日升昌经营的后期，形成了大量的呆死账贷款，主要有两部分，一是贷给官吏和官府的款项。到清朝末年，由于政局变动，贷给官吏和官府的大量款项根本就无法收回。二是贷给商户的款项。在日升昌的经营中，十分注重信用，这也为其赢得了信任，日升昌留存下的账目赢得了许多客户，但是在信贷业务中也只是一味地依赖于信用，不采取任何的担保手段，致使贷款到期难以收回而承受了巨大的损失。大量的呆死账贷款，使日升昌的经营周转发生了困难。日升昌自身业务不需要担保，但却对外提供了担保，这也是它经营衰败的直接导火线：日升昌北京分号因为祁县合盛元票号提供担保，受合盛元倒闭的牵连而于1914年离京撤号。债权人起诉后追索到了平遥总号，日升昌进入清理、偿债期，从此一败涂地。
