京杭大运河具有极其重要的、厚重的、永久性的历史文化价值。主要体现在以下几个方面：
第一，它是世界上开凿最早、最长的一条运河。上文已谈到的世界上著名运河如苏伊士运河、巴拿马运河、基尔运河等，就开凿的时代、运河的长度等来说，都无法与我国的京杭大运河相比。毫无疑问，京杭大运河是世界运河之最。
第二，京杭大运河的开凿与治理工程充满了中国人的高度智慧，闪耀着中国古代科学技术之光。最突出的例证除元代郭守敬从昌平白浮泉引水，西折南转，流注瓮山泊，然后再汇入积水潭，从而开通通惠河之外，明永乐间尚书宋礼奉命治理山东境内元代开凿的会通河时，汶上县老人白英献计，导百余泉水汇入汶河，然后在戴村修筑五里长的戴村坝，分汶水四分南流入淮泗，六分北流入漳卫。这一科学的技术措施是明代二百余年将东南的米粮源源不断地漕运京师的重要保证。而奉献这一智慧的白英老人，竟是山东汶上县的一位农夫。
第三，京杭大运河是元、明、清的京师即元大都和明、清北京城的生命线，是八九百年间北京水路交通的大动脉。正是依赖京杭大运河，元、明、清三朝才能将中原和江南的米粮每年以数百万石的份额漕运北京，支撑着封建朝廷对全国的统治。可以这样说，京杭大运河是元、明、清相继建都北京的不可或缺的重要条件。
第四，京杭大运河为北京的城市建设做出巨大贡献。特别是明、清时期，北京的宫殿、城池建设所需用的木材、砖瓦等物料，大都是通过大运河运到北京来的。明永乐、嘉靖年间建北京城的宫殿、城垣及皇陵时，所用的大批楠木、杉木多是从四川、云贵、两湖等省砍伐的，先由长江漂运到扬州，然后转入运河，再运到北京。北京城市建设所用的苏州的大金砖、临清的大城砖等，也多是由运粮的漕船带运到北京的。
第五，京杭大运河带动了沿途一系列城镇的发展和兴盛。从南到北，如浙江的杭州、嘉兴，江苏的苏州、无锡、常州、镇江、扬州、淮安、徐州，山东的济宁、临清、德州，河北的沧州，天津及武清的杨村、河西务，北京的漷县、张家湾、通州等，这些著名的重要城镇的发展和兴盛，都曾得益于大运河的漕运。
第六，京杭大运河促进了我国南北方经济与文化的交流与融合。大运河不仅仅是漕运粮食和建材，南北方的一些商人也多利用大运河贩运各种商品，如南方的丝绸、家具、纸墨文具等，北方的牲畜、煤炭等。通过这些物资交流，无疑会促进南北方的经济发展。此外，南方的一些举子进京赶考，京城的一些官员学士出京赴任，也常常乘舟坐船，南北往来，也无疑会促进南北文化的交流与融合。
第七，在元、明、清的几百年间，有许多的官员、文人、学者、游客在经由大运河北上南下的时候，留下了大量的与大运河有关的诗词歌赋、笔记小说、游记文章等。这是一笔宝贵的历史文化遗产，也是京杭大运河历史文化价值的一个不可忽视的方面。
总之，京杭大运河的历史文化价值说不完、道不尽，无论给予多么高的评价都不过分。