清军所以轻取北京，是因有一支以八旗子弟为主体的庞大的军队。八旗男儿，从小就习武练箭，个个性喜武功，人人气盛好强。还因为旗人从历史上就过着戎马生活，他们生的男丁就是养育兵，前途就是从军入伍。因此旗人不仅英勇善战其个性也以强悍著称。
清皇太极入关称帝以后，明福王朱由崧逃来南京立起了南明第一个小朝廷，与清军抗衡。清顺治二年（1645年五月），清豫亲王多铎，率八旗军南下，没费多大力气就攻占南京，捕俘了福王。改南京为江南省，改应天府为江宁府，设置江南部统署和将军署，驻进明皇城。继而清政府指令南京的都统做三件大事：一曰筑驻防城，二曰奖励八旗官兵，三曰加大民间税收。
驻防城设在原明皇宫城垣的西边，南接通门东侧，北至太平门内皇城角。沿用旧皇城的西墙往西至今公园路。据《康熙江宁府志》：把整个东城区都包括在满城（即驻防城）之内，成为八旗的天下，汉人不得入内。城内南设”都统署”，北置”将军署”，以统率全军。
根据《八旗通志》记载：清初旗人官兵及家属每人可分享圈地30亩的福利，圈地内的房屋也随地分给旗民居住，土地自种或给他人耕种，凡圈之土地房产权，清廷又明确归旗人所有因此旗人又可以转卖房地产。这就是清政府关爱奖励给其子民的福利，还美其名曰：”旗民生计”。
旗人抢走皇宫公署或皇亲府院以后，民众并无怨言。但是，旗人抢走普通百姓的土地和房屋，就使得百姓无家可归，无地耕种，使之流离失所，哭告无门。再加上清政府及其贪官巧立名目加大商庶的税收。为此激起汉人及其他民族全国性的反清斗争。
1850年11月，太平天国在广州起义。经过两年多的艰苦奋斗，英勇作战，打破清军的重重包围，顺江东下。”帆幔蔽江，前后数十里”，百万人马，一路滔滔，势如破竹、连战皆捷。1853年3月，兵至芜湖，抵采石，打进西善桥一带，扎营24座。消息传来，南京老百姓兴高采烈，纷纷主动去帮忙，有的义务贴传单，有的拿起刀枪帮助太平军杀旗兵。各方百姓还”争献贡物”。
1853年3月19日清晨，太平军轰塌仪凤门，大队入城；继而神策门，汉西门，南门皆攻入，首先斩清朝钦差大臣、两江总督陆建瀛，再攻占驻防城时，斩江宁将军祥厚，副都统霍武，杀死旗兵四万余人。旗官兵家属见状，纷纷自杀，尸骨成山。据《首都志?大事表》：”清顺治六年（1649年）建驻防城。清咸丰三年（1853年）二月乙酉城破，将军祥厚等退守驻防城，施败死亡。太平军遂屠驻防城万人。”同治三年（1864年）6月清军又攻陷天京。10月重建驻防城同治十一年，（1872年）重建将都署，共用银四万七千余两。重建的驻防城再毁于民国初期。将军署和都统署也被毁尽，而今只留下都统巷的地名，在今通济门以东方的尚书巷一带。这一带目前还有不少居民是满族旗人。由于旗人两次在南京受到重创、死之甚多。辛亥革命后，满民遭受歧视，生活非常贫困，老的无所依，小的流落街头靠青壮年卖苦力获得微薄收入。后来有慈善家冯梦华等人资助。于1913年，在尚书里建旗宅270间，但后来又多毁于日军军火之中。
解放后，满民恢复了民族成份，对生活困难户给予补助，满民与各民族之间，亲如兄弟，愉快地生活在安定团结祥和的环境里。然而，在明朝末期。，在统一女真各部的过程中，把女真人编成八旗，每旗有许多牛录，牛录是编制的基本单位一个牛录300人。旗人”出则为兵，入则为奴”。平时耕猎，战时出征，为统治者当炮灰，他们南征北战，历尽沧桑，仅南京”驻防城”一战就牺牲四万多人。至1953年统计时，南京的满民，只有二千人左右了。民国十九年，在大校场建飞机场。国民政府下令将旗人的”枯骨坟”移走，当时开坟后，已是白骨一堆，不堪入目，由广利慈善会等负责迁至石门坎宫后山，并立碑文四字：”枯骨公墓”。但旗人父老不忍叫”枯骨坟”，就改成现”白骨坟”了。