袁世凯说：“马观察，我倒是觉得你完全可以出面，这样方显示出宗主国的地位，也同时向日本表明，朝鲜是大清的属国，让他们不要歪打主意。”
马建忠解释说：“自主自强，方是朝鲜的出路。朝鲜不断强大，方可断列国觊觎之心，这也是宗主国所乐见。我国可以帮助属国开国自强，但不能越俎代疱，因此，与日本人谈判的事情，还是请朝鲜派员去谈。”
打发走两人，马建忠这才解释说：“当着朝鲜官员的面，有些话不好说。力避中日之间发生摩擦，是朝廷对我们此次出兵行动的明确要求，既不准发生军事摩擦，防止擦枪走火，也不准外交上产生摩擦，避免置我国于不利地位。因为法国在越南寻衅，朝廷必须力保朝鲜无事。”
袁世凯说：“避免两面受敌自然不错，可是一再退让并非善策。比如朝鲜是中国的属国，我们帮他救灾，帮他平乱，要耗粮饷，耗军械，还要牺牲兵勇性命，可是内政、外交又坚持不干预，让他自主，我们岂不是只当个冤大头？日本派几条军舰来，张口就要兵费，他凭什么要兵费？内政让朝鲜自主，外交上我们又不出面，宗主国的地位在哪里体现出来？要我理解，坐下来与日本谈判的应当是大清国，朝鲜是大清的属国，你与朝鲜交涉，当然要大清出面。就好比一把椅子，你说是你的，别人要来搬的时候，当然我就可以直接对他大喝一声，别动，这是我的椅子。”
马建忠说：“话不是这么说。属国自主的传统已经延续了几百年，历来如此，何况比方毕竟是比方，朝鲜毕竟不是一把椅子。如果算是把椅子的话，也是放在大清院墙外的椅子，已经在那里放了几百年，突然要搬进院中，容易引起异议。”
袁世凯却固执已见：“从前放在院外，是因为没有贼惦记。几百年前大清国力强盛，没人敢扎煞毛。现在不同了，列国有坚船利炮，可以从万里外跑来与大清争东夺西，这放在院外的椅子已经不安全，所以必须搬进院内，这又有什么好说的？”
这话竟然驳得马建忠无可解说，心中禁不住火起，要论外交，你袁世凯还没启蒙呢，还在我面前大言不惭！他毫不客气的说：“慰廷，论打仗，我不如你。可是要说到外交，并非人人都能黯其中奥秘。马某跟随李中堂多年，也曾经出国考究，尚不敢肆口妄言，你我还是尊令而行吧。”
场面有些尴尬。张謇打破沉默说：“只顾听你们两人高谈阔论，忘了正事了。”
于是将吴长庆希望设法绊住李载冕的意思说给马建忠。马建忠说：“恐怕只有再行诱捕之计。”
张謇说：“大帅的意思，并不是拘捕他。”
马建忠说：“我知道大帅意思，不是拘捕，但却要他跳不出大帅的掌心。硬去拿人肯定不行，所以只有像对付大院君一样，请他入瓮。”
张謇说：“有大院君的前车之鉴，他恐怕不会上当。”
马建忠说：“那就想个他无法拒绝的理由。”想了许久，说，“他以至孝自许，在国王面前哭求，也是以孝的名义，那就让他来商讨如何释回大院君的事情，他恐怕不能不来吧？”
张謇说：“他来恐怕也会万分小心，如果带着大批卫队来，我们能奈其何？”
马建忠看袁世凯一眼，用激将的语气说：“这就看慰廷到底有多大本事了。”
袁世凯一拍胸脯说：“来不来的事，你们费心；拿下他卫队的事，交给我来处置。”
张謇说：“慰廷，这可不是闹着玩的。”
袁世凯说：“老师不必担心，他不敢带大队人马来，如果带大队人马，无异于公然反叛，城外的大军正用得上。如果他只带几十人卫队，对先锋队来说是小菜一碟。”然后派人出城，调先锋队入城，并与吴长庆约定，如果需要大军支援，就让人放红色信号弹。
马建忠说：“慰廷，这应该悄悄布置，你明目仗胆调先锋队入城，李载冕会立即知道。”
袁世凯说：“行的就是镇慑之计，让他知道如果心存反抗，则会就地剿灭。”
张謇和马建忠都觉得袁世凯行事太险，太过张扬，但袁世凯却一再表示，他愿负其责。那就没什么好说的了。马建忠派人给李载冕送信，果然他回话说：“军中诸事纷繁，恕不能抽身前来。”
马建忠再派人持亲笔信去，让送信人从大门口开始嚷嚷，马观察请李将军商议释回大院君的事宜，如果李将军不能赴约，大院君则不能释回。
李载冕知道推托不过，亲自到南别宫来，身后跟着三十人的卫队。南别宫大门敞开，只有两个门岗，对李载冕一行连问也不问就放行。进了二堂袁世凯站在大厅前的台阶上，说：“李将军，我奉马大人之命，在此恭候，请将卫队留在此处，您请只身入厅。”
卫队统领说：“请马大人出来相见，我们奉命保护将军，寸步不离。”
袁世凯说：“李将军带这么多人到南别宫来，来者不善呢。如果不将卫队留下，马大人不会相见。”
卫队统领问：“如果我们非要与将军一起进见呢？”
袁世凯说：“那就别怪我不客气，就地剿灭！”
袁世凯一挥手，四十名先锋队一色洋枪把二堂院子包围起来。
李载冕说：“我知道此行必是鸿门宴。”对卫队统领挥挥手说，“你们退下吧。”
卫队收起刀枪，退出二堂院子。李载冕只留下翻译，大声说：“马大人，既然请我来议事，就请出来一见吧。”
马建忠从二堂大厅中走出来，说：“李将军，乱兵未平，不得不如此，请见谅。”
李载冕说：“汉城秩序井然，何来乱兵。”
马建忠说：“乱兵都在枉寻里、利泰村，这谁不知道？”
李载冕说：“他们都是奉太公之命撤出京城驻扎，马大人怎么称之为乱兵？”
马建忠说：“杀害朝廷重臣，硬闯王宫，逼死王妃，肆行抢掠，国王都险些遇害，不是乱兵是什么？”
李载冕说：“马大人，他们严守太公之命，屯驻枉寻里、利泰村，井然有序，不信可请太公复临。马大人说与我细商释回太公事宜，请马大人示下。”
马建忠说：“实不相瞒，太公已经乘轮去天津。今天请将军来，是请将军脱离是非之地。今晚大军将对乱军进行围剿，将军若安居南别宫，便无被乱兵协迫之虞，事急从权，还忘将军宽宥。”
李载冕说：“他们都是贫苦士兵，被克扣军饷，无以为生，才不惜铤而走险。请马大人可怜他们，不要枉杀无辜。太公被囚，我自知难安于位，已经将印授带来，一并交给马大人，我不做什么将军、判书了。”
马建忠摇摇手说：“李将军，马某岂敢？你是朝鲜的将军，做不做，那由朝鲜朝廷决定，我们绝不干涉。请将军放心，您只要不出南别宫，一切不加限制。我已经略备薄酒，给您压惊。”
事情非常顺利，张謇和袁世凯出城回营复命。吴长庆已经对晚上的军事行动做了部署，六营人马分为两路，一路前去进攻枉寻里，他则亲率两营去攻打利泰村。袁世凯的先锋队跟随吴长庆行动。袁世凯找到吴长庆说：“世叔，侄儿愿率先锋队打前锋。”
吴长庆说：“这是真刀真枪打仗，你从未经过实战，我怎么放心让你去打前锋？”
袁世凯说：“世叔放心，我不会死打硬拼，我读那么多兵书，自然会活学活用。再说，不让侄儿打前锋，与先锋队的名号也不相趁，别人会说三道四。”
吴长庆问张謇：“季直，世凯是你的学生，你说我该不该让他打这个前锋？”
张謇说：“大帅就放手让慰廷去一试身手吧。自从入朝以来，他所办理的事情，经常给人意外之喜。”
晚上十点，大军起程，不到一个小时就到利泰村。利泰村、枉寻里都是朝鲜旧军及家属世代居住之地，与吴长庆的大营呈犄角之势，相隔不过十里，利泰村离得更近一点。袁世凯带先锋队摸过去，接近村子时突然从屋子里射出子弹，在暗夜里划出一道道亮线。陪在袁世凯身边的赵国贤腿上中弹，哎哟一声趴在地上。袁世凯也一哆嗦连忙趴到地上，等发觉子弹大多从天空中划过，并伤不到人时，胆子大了，感觉自己这先锋队统领趴在地上不是那么回事，躬着腰躲到一堆石块后，说：“听我命令，都小心趴在地上，先别乱动。”
他观察了一会儿，前面是一片空地，没有任何遮挡，如果乱哄哄向前冲，伤亡少不了。他发觉房子都是草顶，就有了注意，命令两个什长各带十人，把全队火把集中起来，背在身上，爬到草房跟前把所有火把点着了，向着房顶乱扔一气，顿时火光冲天，里面的人乱纷纷向后跑。袁世凯命令：“兄弟们都跟我冲，见人就开枪，都把枪里子弹打光了。”
先锋队的冲锋号呜嘟嘟吹响，全体兵勇躬着腰向前冲。枪声叭叭响成一片，但全是冲锋队的来复枪声，乱军几乎没再响一枪。从房子里跑出的人都蹲在地上举着双手，几乎没遇到一点抵抗。袁世凯发现已经跑到了村子的另一头，依然没有发现大队人马。他找来翻译，叫过蹲在地上的一个老者问话，老者说：“听说上国大军来到，几天前人都跑了个差不多，今天晚上又跑了一部分，剩下的都是老弱残兵。”
袁世凯命人把蹲在地上的人集中起来，数了数只有三十余人。他感觉很不尽兴，说：“这仗打的，还没打就结束了。”
这时候吴长庆率军过来了，问：“世凯，伤亡如何？”
袁世凯有些丧气的说：“只伤了两人。这仗打的，真没劲。”
吴长庆说：“还头回听说打仗嫌伤亡少的。你战果如何？”
袁世凯说：“只俘虏了三十来个人，早就都跑了。”
吴长庆说：“这就不错了，我第一次接仗，伤亡了二十多人，才俘虏了人家二三十人，你算幸运了。”
吴长庆下令大军凯旋，命袁世凯押着俘虏回大营。回到营中，天光大亮。不久后，另一路人马也回来了，押着一百余俘虏。这时天开始下雨，俘虏们蹲在泥地上，非常狼狈。张謇冒雨前来查看，发现大多是老人孩子，老人目光茫然，孩子眼含胆怯，心中顿生怜悯，对看管他们的兵勇说：“你们别太凶了，别吓着孩子。”
他找到吴长庆说：“筱帅，这些人都是穷苦人，不要过于为难他们。筱帅可否请国王派人来分别审讯，区别主从，惩治部分主犯以儆效尤，协从者则最好一律释放，也给那些逃散者一条生路，让他们主动归降。不然把他们逼上绝路，舍命相搏，反而不易收功。”
吴长庆说：“季直真仁者也。我也正有此意。请国王派人来审，还可体现属国自主之义。”
国王派人来审，用了一天多的时间，区分主从，决定处决十五人。张謇认为太多，建议将其中五人改为徒刑，经马建忠向国王提议被采纳。国王又颁布招抚文书，只惩元凶，协从不问。逃散各地的乱军纷纷前来自首，兵乱很很快得以平定。
但日朝谈判的结果却有些差强人意。到济物浦与日本人谈判的全权大臣是奉朝贺（退休官员的一种荣誉官名）李裕元，实际负责谈判的是全权副官、工曹参判金弘集。两人根据马建忠的指点，与花房义质辨论，双方僵持不下。双方最争议的一是赔款数额。日本提出共五十五万日元的巨额赔偿，朝鲜认为太多，花房义质提出将赔款减至四十万元，但朝鲜须以矿山采掘权、电线架设权，咸兴、大邱两地开放为通商口岸等为交换条件。马建忠认为这两条损失利权太多，宁愿多付十万元，也不能答应。而且“赔偿”二字于国际法不合，把“赔偿”二字改为“填补”。第二项则是日军驻扎汉城。花房义质以使馆被焚为由，认为朝鲜根本不能保护日本使馆，因此必须准许驻军保护。马建忠建议朝鲜无论如何不能答应，而日本则对朝鲜深怀野心，坚持非驻军不可。结果最后折衷为“日本公使馆，置兵员若干备警”。此外还有朝鲜派出官员到日本去谢罪、扩大日本在朝商务权益等内容。大家都觉得日本无疑还是在朝鲜取得了驻兵权，以后朝鲜的局势会更加复杂。袁世凯尤为不满，他私下对吴长庆说：“马观察以擅长外交自傲，我看也不过尔尔。我军已经平定兵乱，占据优势，而仍然让日本取得驻兵权，这算办得哪门子外交？宗主国权利没有任何增加，而日本却获得如此多的权益，恰如身上长了个巨疮，早晚要危及性命。可笑马观察还洋洋自得。”
吴长庆说：“世凯，外交的事情不在我们的职责范围，我们不可说三道四。这次入朝你功不可没，我十分欣慰，我即将咨请李中堂、张振帅奖赏有功人员，把你列为首功，我给你的评语是：治军严肃，调度有方，争先攻剿，尤为奋勇。我为你请实授同知，李中堂、张振帅能否同意，朝廷能否旨准，我就不敢保证了。”
袁世凯捐的官职是中书科中书，一个从七品虚衔，而同知则是正五品官员，那可是连升五级！袁世凯非常激动，跪地磕头说：“侄儿谢世叔的提携之恩，无论朝廷是否旨准，侄儿对世叔的大恩永世不忘。”
吴长庆说：“起来起来，是你自己争气，我不过是顺水推舟。我对你父亲也算有个交待了。还有你张老师一直在帮着你说话，他的推荐之恩，你可不能忘了。”
袁世凯说：“侄儿不敢忘恩负义，我这就去看张老师。”
吴长庆说：“我报功的事你不必细说，如果传扬出去，难免有人反对，那就弄巧成拙。”
袁世凯到汉城去买了一坛米酒，一提打糕，还有一对鼓，由一个亲信稽查兵提着去看张謇。张謇正在埋头修改文稿，说：“慰廷，买这么多东西，你要回国？我没听筱帅说。”
袁世凯说：“不回国，我是孝敬老师的。学生自入朝以来，老师多次向大帅推荐，世凯没齿不忘。”
张謇说：“你这话就见外了。外举不避仇，内举不避亲，我向筱公推荐，实在是你有过人之处。你到朝鲜来多后，许多次让人刮目相看，我即便不推荐，大帅也会用你。”
袁世凯说：“这是朝鲜人节日用的鼓，长的叫长鼓，是女子所用，短的叫平安鼓，由男子所敲。两鼓成对，则意寓平安吉祥。都是不值钱的东西，到时候老师带回国内，做个纪念。”
“那我就愧受了。”张謇话题一转说，“慰廷，这些天我一直在考虑朝鲜如何善后。朝鲜小邦，群狼环伺，大清这个宗主国，应该怎样保朝鲜？我很赞同你的观点，与其有名无实，不如把朝鲜废为郡县，反而容易存续。这早就有前例，汉初，武帝征服卫氏朝鲜，设为乐浪、玄菟、真番、临屯四郡，今日不妨参照汉例，就像日本废琉球一样，列国未必有多少话说。如果废为郡县不可行，也可沿袭周例，置监国，或置重兵守其海口，而改革其内政。”
袁世凯对此极为赞同，两人谈得十分投机。
“如果朝廷连这两条也不能赞同，那么朝鲜必须改革内政，如果依然如此行政，难免重蹈此次兵乱覆辙。”张謇扬扬手里的文章说，“我提出了朝鲜善后六策，准备上书李中堂和张振帅，督促朝鲜改弦更张，革新自强。”
张謇提出的善后六策，第一策是通人心以固国脉，要顺应民心，参与兵乱的士兵与百姓，不要再加凌逼，“概加以罪，立国者将何从易民而治也？不如此，远而五六年，近而三四年，祸且踵至，何治之可图！”第二策是破资格以用人才，“令八道布告士庶，各得条陈救时良策，封进以抉择之，其武者，则考其方略，验其胆力；其文者，则试以牧民，随时甄别，引其优者任用之。”第三策严澄叙以课吏治，第四策是谋生聚以足财用，第五策则是改行阵以练兵卒，第六策是谨防圉以固边陲。
张謇谈得头头是道，而袁世凯最感兴趣的则是第五策，他说：“老师，学生是带兵的，所以对第五策练兵的建议很感兴趣，学生愿闻其详。如果有可能，将来希望能够帮助朝鲜编练新军。”
张謇觉得自己是纸上谈兵，没想到袁世凯却极为认真，并很快从中发现了自己的机会，此人思维如此敏捷、独到，将来必成大事。
他说：“慰廷，你既然对练兵如此感兴趣，我不妨纸上谈兵，说说我的短见。”