心灵层次分析是卡尔·荣格最为经典且最负盛名的理论。在这里，他在恩师弗洛伊德的“前意识”观点上更进一步地提出了“个人潜意识”和“集体潜意识”。对很多初学者而言，弄清意识和潜意识之间的区分是有些困难的，而且这些看起来过于艰深、晦涩的理论也缺乏实际意义。
但是事实证明，正是在荣格提出心灵层次分析理论后，人们在克服很多诡异的心理疾病的时候才显得有法可依。在现实生活中发生过很多“老好人”转身变为“嗜血魔头”的事情，比如20世纪80年代的“美洲杀手”阿隆索·洛佩兹，很多熟悉他的人都将其视为勤勤恳恳的老好人，但是他却制造了300余起命案，而这一切都要从心理层面进行分析。
在荣格眼中，每个人都是非常复杂的，认识一个人不光要从他所做的事情来进行判断，还要结合他所处的社会环境以及时代背景。在与西格蒙德·弗洛伊德决裂之后，荣格并没有放弃对意识和潜意识的研究，而是在对方的理论基础上进一步提出了“心灵四层次”理论。可以说，“心灵四层次”的提出为解释很多看上去“非常怪异”的行为带来了巨大的帮助。
在古希腊民主政治全盛时期，有一名叫阿里克勒亚的年轻人失手打伤了一名外乡游客，于是当地的长者召开了一次集体大会，通过投票的方式将阿里克勒亚逐出本部落，5年之内不准他回到家乡。受到部落遗弃的阿里克勒亚离开家乡之后四处流浪，并且在雅典做过一年多的苦力。等5年期满之后，阿里克勒亚才重回家乡，结束了四处漂泊的日子。而此时由于长时间的磨难，他老得很快——手粗糙不堪，眼角布满了皱纹。但是不管怎么说，阿里克勒亚还是坚持了下来，他在离开家乡的5年时间里接受了应该受到的惩罚。
其实，这本来是一件再平常不过的事情了，但荣格却从其中找出了“心灵四层次”的影子。在他的理论中，荣格将意识分为“个人意识”“个人潜意识”“集体潜意识”“集体意识”四部分。他将阿里克勒亚伤人、被驱逐、流浪、返乡这一过程完整地分析了一遍，并且一一分解开来。
（1）个人意识
荣格认为，个人意识是指人有意识的心智。它是心灵中关于认知、感觉、思考的那一部分。当时的情况是，阿里克勒亚看见自己的母亲赫拉提斯将一位自己从来都没有见过的男子带回了家中，并且给对方饭吃。对此，阿里克勒亚非常不满意，就大声对男子说：“你吃过东西之后马上离开，这里没有多余的床让你睡觉！”
听到这样的话后，赫拉提斯批评了儿子，她对阿里克勒亚说：“孩子，这个人已经很久没有吃过饭了，而且现在天马上就要黑了，风很大，你让他到哪里去？我们把他留在家里，就算让他睡在地板上，也比被赶出门去受冻强啊。”
外乡人听后得意起来，并在旁边不断地说着一些风凉话，讽刺阿里克勒亚心肠太狠，还说赫拉提斯“怎么养育了这样一个儿子”。可想而知，这样嚣张的态度马上激起了阿里克勒亚的愤怒，他举起一根木棒想要赶走这个讨厌的不速之客，但却没有想到外乡人被他打断了腿，变成了残疾人。
针对阿里克勒亚伤人这一事件，荣格认为这就是一个人“个人意识”的体现。他指出，阿里克勒亚在受到他人挑衅的时候怒火中烧，采取了相应的行动。
（2）个人潜意识
对于“个人潜意识”的解释，荣格是这样定义的：它是针对个别心灵而言的，是由一个人曾经意识到但却被遗忘或者压抑，甚至是一些原本就没有被意识到的印象构成的。
对阿里克勒亚来说，几句刺耳的话又怎么能够让一个人性情大变呢？这就需要从“潜意识”的层面分析了。荣格指出，阿里克勒亚生活在一个单亲家庭中，一直和母亲相依为命，因此他有浓厚的恋母情结。对他来说，母亲赫拉提斯就是一切，如果有人试图和他分享这种幸福，那么阿里克勒亚就会无比焦虑，并且愤怒异常。更重要的是，在这个时候，赫拉提斯偏向着外乡人一边，还帮助对方训斥阿里克勒亚，这激化了双方之间的矛盾——阿里克勒亚在自己的潜意识当中认为自己失去了单独拥有母亲的“特权”，于是举起木棒殴打了那位外乡人。
那么，阿里克勒亚为什么会做出如此的举动呢？对此，荣格认为这实际上就是由于他的潜意识在作怪，长久以来对母亲的依恋同如今害怕“失去”母爱形成了尖锐的矛盾。这样看来，阿里克勒亚被判处5年之内不准回到家乡实际上是他替自己的“个人潜意识”背了黑锅。
（3）集体潜意识
荣格表示，除了个人潜意识之外，人类群体也有所谓的“集体潜意识”。集体潜意识是人类通过千万年的历史活动，积累在人脑当中的残留的痕迹。
对于阿里克勒亚背井离乡、忍受重重磨难，荣格提出了这样一个问题：“这个年轻人凭什么会心甘情愿地离开温暖的家乡，漂泊在外，吃苦受罪呢？”
实际上，这就是一个关于集体潜意识的话题了。由于在此之前所有人都对公投出来的裁定绝对服从，这样的风气在阿里克勒亚出生之前就早已经形成了。所以，在所有人的潜意识中，集体裁夺本身就是不可否定的，任何事情一旦被决定下来，那么它们一定都要被执行。换句话说，假如不是阿里克勒亚，换作其他人违反了法律也同样会默默服从裁定的。
可以说，阿里克勒亚将公投出来的结果看作是绝对的权威。实际上，这是人们长期以来对法官的权威崇拜、尊敬之后的遗留产物。正是这种“历史烙印”让他根本无心反抗，即便吃了很多苦，经受了众多磨难，他也毫无怨言。在这里，整个部落的百姓实际上也处于同样一种状态，他们也对集体会议有着与生俱来的敬畏，这就是荣格所说的“前人类和人类残留下来的经验”。
（4）集体意识
对于集体意识，荣格解释说，这是人类心灵普遍存在的结构。在他们眼中，整个世界是有着共同价值和文化的。在判决阿里克勒亚这一件事情上，所有人都认为打伤了人就需要承担相应的责任，这就是一种集体意识的体现。
因此，在荣格眼中，每一个人的内心世界都是一个“魔法屋”，很多时候我们都会做出一些连自己都难以理解的事情。实际上，这并不是什么“受到了魔鬼的引诱”，而是说在这个时候“潜意识”占据上风，并主导了一切。具体到阿里克勒亚伤人一事上，他原本是一个人人交口称赞的青年，结果却因为几句刺耳的话将人打成残废，这本身就是由隐藏在他内心深处的恋母情结所驱使的。现实生活当中也有很多类似的事情，不少“乖孩子”会在特定的条件下做出让人大跌眼镜的举动，对于这样的事情，人们还是需要区别对待的。因为这并不意味着当事人已经“自甘堕落”，在很多时候，他们只是被自己的潜意识驱使了而已。