在印度雅利安人的《摩诃婆罗多》史诗中，有一段关于洪水的神话传说。史诗说，太阳神的儿子摩奴，原本是一个德行高尚的圣仙，在河岸边长年修炼严峻的苦行。
有一天，摩奴在岸边拯救了一条无助的小鱼，并把小鱼喂养长大，最后把长大的鱼儿放归圣洁的恒河，并让鱼儿游归大海。
事实上，这条鱼儿就是生主大梵天的化身，他就像《圣经》故事中上帝耶和华怜悯慈悲善良的诺亚一样，吩咐摩奴要在大洪水淹没世界之前，建造坚固的大船，带上北斗七星这 7 位仙人，还要把各种生物的种子都带上船，以等候鱼儿的救援。
摩奴按照鱼儿的吩咐，作了应急的一切准备后，果然洪水铺天盖地而来，吞没了大地的一切。在惊涛骇浪中，摩奴和仙人乘坐的大船由于得到鱼儿的救助和牵引，才得以安全在雪山高峰上停泊。后来，太阳神之子摩奴便生出了造物的愿望，他又开始更为艰辛的苦行，并用他苦修获得的神力创造了更加完美的生灵。
洪水神话在古印度的经典中还有多种形式的流传。这反映古代印度先民同中国、美索不达米亚的古老民族一样，对洪水的屡屡肆虐难以忘却，并都习惯采用神话传说的形式，把洪水对人类的危害，经过演绎而成为各种离奇的故事。
考古发现也证明，摩亨佐·达罗等印度河流域的城镇，曾屡屡遭到过印度河洪水泛滥的袭击，有的河流也因此改道而变成涓涓细流，乃至于干涸。
考古学家注意到，印度河城市都筑有防护的砖围墙，城内的主要社区多建在高地上，这显然是出于防洪水的考虑。然而，面对洪水的肆虐，摩亨佐·达罗等地的居民似乎还是显得无能为力。在印度河文明延续发展达近千年的过程中，城市建筑遗迹已堆积成十数米乃至几十米的文化层，后来的居民实际上就是在前人放弃的旧居废墟，或是在洪水退后的故居上重建家园，这样长此以往，才会形成不同时期的建筑遗迹的堆积，如摩亨佐·达罗的西部被称为“死亡之丘”的高地，就是公元 2世纪的僧侣在该城废墟上建起的佛塔遗迹。
印度河城市的考古发掘还碰到一个很大的困难，那就是遗址越往下挖渗水越多，以至无法把下面的文化遗迹和遗物完全揭示出来。其原因就在于，经数千年的洪水泛滥和淤沙堆积作用，印度河的河床就像中国华北平原的黄河一样抬高了许多，现今的河水面已高于考古学家发掘的古城遗址，所以河水才透过泥沙层渗流到城址中。
在哈拉巴城址，人们也发现过当地先民持续生活达 500 多年的地层现象。如一个遗址较下层的陶窑，其年代为公元前28 00年，其上部又依次迭压了几个陶窑，最晚陶窑的年代为公元前 2300年。遗址出土的人工制品如陶器等，其文化风格的演变是连续性的，并没有外来因素促使文化产生突变的现象。
因此，有人干脆断言，印度河城市的衰亡，完全是居民不堪洪水的肆虐，他们只好放弃世世代代居住的城堡，转移到远离印度河的其他地方去了，天长日久，原来的城市便衰落成一片荒芜的废墟。
有的学者还引述气象科学的记录来支持上述观点。人们熟知，在热带区域、海岸地带、岛屿，尤其是大河口冲积平原，很容易受到海啸的冲击而引起毁灭性的破坏，而这种海啸每年是由飓风伴随着地震和暴雨引起的。南亚次大陆半岛就是这种灾难的高发区。
1876 年，就有过这样的记录，当时巨大的飓风席卷孟加拉湾，并向恒河口岸刮去，挟着惊天动地的雷霆暴雨，飓风中心200英里周围的海上，船桅被打得粉碎，沿岸正处于落潮之时，退潮遇上范围又大又深的飓风，结果变成了被飓风托起的巨大的海啸，冲入恒河地区，使内地的海水升高达5 0英尺，141平方英里的陆地被淹没，造成21 5000人死亡。
不过，我们认为印度河的洪水泛滥，更主要的原因，还是来自中上游及其支流非正常雨季带来的特大洪水。
尽管南亚次大陆是地震、水灾、飓风等自然灾害的高发区，但我们认为这一点还不能够足以成为印度河文明彻底毁灭的原因。事实上，次大陆的人民在历史上，往往都能在一时的沉重打击下再度崛起而重建家园。