目前科学家从海水环境的角度，解释了马尾藻海的成因。
原来，在大洋的某些地方，有些海水会像河水那样流动。马尾藻海四周为几条顺时针方向奔流的海流所包围，西面和北面是墨西哥湾流及其延长部分—北大西洋海流，东面是加那利海一流，南面是北赤道海流，几条海流终年不息地围绕着马尾藻海流动，使表层海水不断地向中央聚积，形成几百米厚的既温暖又均匀的“马尾藻水”，水温常年在25℃左右，非常适于马尾藻的生长和繁殖。在这里，大量繁殖并旺盛生长着马尾藻，使茫茫的大海铺满了几尺厚的海藻，海风吹来，海草随浪起伏，呈现出一种别致的海上草原风光。