【证据1】：前面已经提到，林黛玉是绛珠草，——红色的草木，即赤心木，也就是喻指她姓朱，代表了朱明王朝。
【证据2】：林黛玉是多愁多病、弱不禁风、病西施，又有咳嗽的旧疾——喻示朱明王朝到崇祯朝时，已经多灾多难，风雨飘摇，又沉屙难起。将林黛玉比作西施，当然不是说她是红颜祸水，而是说她和西施一样，经历亡国（西施亡吴国），暗示崇祯是亡国之君。
【证据3】：在鸳鸯三宣牙牌令时，林黛玉抽到的牙牌，揭示了她的“天子”身份——当时只有林黛玉和贾母第一张就是“天牌”（上六点下六点叫天牌）。贾母是老祖宗，喻指朱家老祖宗，应该隐喻是明朝开国皇帝朱元璋了，所以贾母抽到天牌时说的牌令很有气势“头上有青天”，最后一张更有气势：一轮红日出云霄。
而林黛玉第一张也是“天牌”，但她说的诗完全是一副“末世”景象：“良辰美景奈何天”。处处透露出自己的力不从心、无可奈何。的确，明朝到“她”手里时，已经积重难返，当年气势雄伟的大明天下，如今已经是“奈何天”了。这句诗是出自《牡丹亭》，下面还有一句。林黛玉听过这段戏。书中二十三有提到：“黛玉听了，倒也十分感慨缠绵，便止住步侧耳细听，又听唱道是：‘良辰美景奈何天，赏心乐事谁家院。’听了这两句，不觉点头自叹，心下自思道：原来戏上也有好文章。”
良辰美景奈何天，赏心乐事谁家院？
让我很快想到了那句：昨夜朱楼梦，今宵水国吟。
这两段诗联系起来看，更具对比效果：纵然是良辰美景，已经是无可奈何天，朱楼辉煌已成昨夜梦幻；如今赏心乐事的是谁，原来已经换做了水国人在欢歌吟唱。
【证据4】：葬花。
关于黛玉葬花，必须单独拿出一小节来讲，因为历来对“黛玉葬花”的误读非常多非常深，完全背离了作者的原意，黛玉葬花的真正喻意是什么？请看《2.3被误读三百年的黛玉葬花》。
【证据5】：吴本里的证据
前面都是依据前八十回里的文字的推测，在吴本（癸酉本）后28回，那已经是写得非常直白了，特别是写林黛玉自杀那场景，完全是崇祯当年殉国时情景再现。
有朋友说：因为癸酉本后面太写实了，所以让人觉得假。这个质疑不无道理，但不妨反过来想，正因为癸酉本后28回太写实了，文字里处处弥漫着亡国之痛、骂清之声，所以后28回才会被砍掉，才会被禁绝，才有了满清朝廷组织力量修改、删减、续书，然后删掉一切批语，只留一个本子，组织刊印，这就是后人看到的通行本。目前公认发现最早的抄本，就是胡适得到的甲戌本，那是乾隆十九年（甲戌年）的本子。这也是民国时期才传出的，而且还是个只有80回前断断续续十几回的残本，80回后的文字一点也没有。而清政府组织刊印的本子，就是程甲本、程乙本，就是后来的通行本。通行本不但有了高鹗续写的40回，而且前80回里的文字也多有删改，比如秦可卿天香楼的故事，比如每一回前面的回目诗都没了，就连各个抄本里的所有批语，全都删得干干净净，彻底将《红楼梦》变成了大家族的风月儿女小说。可见清朝的封杀工作做得多么到位。所以，我们不能以想当然的逻辑来判断吴本的真假，要更多的是从文字、从情节故事上，吴本后28回是否合理。
至少，从黛玉的结局来看，吴本是写得非常合理的，契合了她的判词，以及前面埋下的伏笔，也完全符合林黛玉一贯的性格。我们之所以会觉得后面写得反差太大，其实吴本后28回里的林黛玉，与我们所了解认识的林黛玉反差大。我们中大部分人，是自小就通过红楼梦的影视剧、戏曲等来认知林黛玉和红楼故事的，并不是书中真实的林黛玉，一说到林黛玉，我们自然就浮现出各种影视戏剧形象的林妹妹，心中早已有了先入为主的印象，自然很难接受，将她和崇祯皇帝联系起来。
我们简单看看，吴本里如何写林黛玉之死的，以及是如何影射崇祯之死的。
故事在吴本的第九十七回《鸳鸯女谮语泄天机绛珠仙泪尽抛全生》
A.【死亡时间】
根据鸳鸯行为时间，可以推断出，林黛玉死于三月十七日后两天，也就是三月十九日。癸酉本这段是这样的：
且说鸳鸯本来想趁着贾家落败，自己也好浑水摸鱼，谁知无端冒出一个小红精明强干，几次三番把贼寇击垮，心上那点冀望也要化为乌有，拿定主意，偷了各房一些东西用衣服裹了趁夜黑逃出贾门，另作高就。
只见夜已三更，碧云横空，月华如泻，心想：“前儿是三月十五，月又大又亮今儿十七月还是这么圆，直照的地上明晃晃的，只是别叫人看见了才好。”
第二天鸳鸯向林黛玉进谮言（反间计，诬陷小红），林黛玉当时就拷打小红，结果小红一死，贾府立马被攻破，林黛玉愧疚自杀。书中虽然没有直写，但时间显然直指“三月十九日”。
崇祯：在西历一六四四年三月十九日，自杀殉国。
其实黛玉葬花时，也暗示了林黛玉的死亡时间，是三月中浣。这个我们后面还会讲。
B.【死亡地点】
林黛玉在柳叶渚边，吊死在槐树下。
崇祯是在煤山（景山），吊死在歪脖子槐树下。但有典故说“在景山东麓，原有一棵老槐树，是明朝末代皇帝崇祯(朱由检)的自缢处。”
也就是说林黛玉和崇祯，都是在老槐树下上吊自杀。
C.【死亡情景】
林黛玉：且说黛玉趁着明月高照在园中急走，只见到处都是尸骨堆积，全是自己的人，心里虽悲愤交加，只是因长年哭啼，眼中已经泪尽，哭不出一滴泪来，知道大势已去，加上药劲攻发，浑身辛苦，又怕被贼人侮辱，污了清白，不如一死倒也干净。
崇祯：临死前，还赐皇后自尽，自己砍杀妻女，我们也可以想见，在前往景山的一路，看到的情景和林黛玉看到的，差不了多少。
D.【死亡原因】
林黛玉：中了小人奸计，错杀小红，园子被攻破，大势已去，又怕被贼人玷污清白，想一死了干净。
崇祯：紫禁城被李自成军队攻破，进退无路，唯有愧恨自杀。
E.【死亡遗言】
林黛玉：（心里独白）我今之罪可算罄竹难书，错杀小红，致使贾家败于我手，众人也受我连累丢了性命，如今我死有余辜，怪只怪苍天无情，包容贼人恶行，轻纵他们肆意作乱，我亦似嫦娥悔意甚深，欲赴广寒宫，真真恨入骨髓。我此刻虽然死了，又怕别人发现不知名姓。虽得了个全尸，却未必有人肯埋。
崇祯：（写在衣襟上）朕凉德藐躬，上干天咎，然皆诸臣误朕。朕死无面目见祖宗，自去冠冕，以发覆面。任贼分裂，无伤百姓一人。
崇祯临死也算是基本认识到自己的问题——“凉德藐躬”，当年将袁崇焕凌迟处死，是典型的愤青思维，心智非常不成熟。林黛玉仅凭鸳鸯的谮言，和一块贾蓉故意留下的“龙禁卫”牌子，就怒不可遏地让家丁将林红玉活生生打死，也是怒气攻心失去理智的举动。
F.【死后安葬】
林黛玉：死后几个月后，被贾宝玉找到，将白骨装入袋子里，和薛宝钗一起，送到青枫林贾家祖坟里安葬。
崇祯：自杀后，主持崇祯尸体下葬的是昌平州吏赵一桂，将崇祯草草葬入了田妃墓。清军入关后，为了笼络人心，听从汉臣建议，将崇祯以「帝体改葬，令臣民为服丧三日，谥曰庄烈愍皇帝，陵曰思陵」。
顺便再提一点，在吴本里，薛宝钗亲自参与了林黛玉的安葬，并且为她留下哀伤的泪水。这是不是有点像清朝重新安葬崇祯、举国为崇祯服孝的事？宝玉因为薛宝钗的这个举动，而对她大有好感，为后来两人结合埋下了伏笔。当年满清这个举动，也大大笼络了汉人的心，北方军民大量归顺清廷，清军还就此打着为崇祯复仇的旗号，进驻北京，一路南下，以追杀贼寇的名义，抢占大明江山。
总之，从吴本后面的文字来看，林黛玉是影射崇祯无疑。