离开大傻谷后，我继续着旅行，在路上我受到了大木博士的电文，给博士打了一个电话。
“小智，那些化石盔，菊石兽和化石翼龙是你在大傻谷里抓来的。”大木博士一出现就直奔主题。
“没错，它们还好吧，我抓了联盟应该没意见吧。”我猜大木博士已经知道大傻谷出现的化石神奇宝贝。
“没问题，我就说是你是我安排的人，你放心，我会好好照顾它们，它们全都刚刚醒来，身体很虚弱，要经过一段时间的调养才能恢复过来。”大木博士知道我很关心神奇宝贝，这话让我安下心来。“小智，它们借我研究一下没问题吧。”
“随便你，大木博士，你只要帮我照顾好它们。”虽然大木博士研究神奇宝贝很尽心，但有时有点过头了，不顾自己的危险，如果发现稀有神奇宝贝，那他就会死缠烂打的黏着对方。好在大木博士也有很强的神奇宝贝，不会有什麽大的危险。
几天后的路上，波克比也在我的期待中诞生了。
“啊，好可爱，波克比你好啊。”小圣说“叫尅布哩~”（这4个字害的我打了5分钟），波克比高兴的叫道，就这样小圣收服了波克比克。
而这天，我继续向着红莲道馆前进，而路上碰到了一位大叔要求进行神奇宝贝的对决，我当然是来者不拒。
“上吧，铁甲犀牛”，大叔派出的神奇宝贝是铁甲犀牛。
“妙蛙草，就决定是你了。”而我想想也差不多到那个不可思议花园了，派出妙蛙草。
“铁甲犀牛，使用猛撞攻击”，大叔率先下令说，然后铁甲犀牛就向着这边冲了过来。
“妙蛙草，寄生种子，然后麻痹粉。”看着铁甲暴龙向妙蛙种子撞了过去，我对妙蛙草下令，像这种横冲直撞的方式是很好的活靶子。虽然妙蛙草被撞飞，到寄生种子和麻痹粉成功命中铁甲，铁甲犀牛不断被吸收体力，补回妙蛙种子，妙蛙种子可以很快的恢复伤势。
“铁甲犀牛，振作啊”，大叔没想到会是这种情况。
“很好，妙蛙草最后一击，飞叶快刀。”妙蛙种子飞出许多叶子，铁甲犀牛因为被麻痹，速度严重下降，根本躲不开，草系对地面系和岩石系效果拔群，而且还是加强版的飞叶快刀，铁甲犀牛直接失去了战斗能力。
“妙蛙草干的好”，我跑过去摸了摸妙蛙草说。
“哒奈~”，可是就在这时，妙蛙草痛苦地叫着，“妙蛙草，你没事吧，难道是…“妙蛙草进化为了妙蛙花。
终于在傍晚，我赶到了神奇宝贝中心。
然后就听乔伊小姐说了妙蛙种子的传说，原来是到了某个时期，妙蛙种子就会从各处涌来，聚集在一块，举办进化的庆典。
“看来我们是迎接了重要的时刻了。”小圣听到后发出感慨。
“看起来很有趣，进化是在哪里发生的？”我这时突然问道。
“在被称为不思议花园的地方哦。”乔伊笑着解释说。
“不思议花园？”小圣没听过这个地方。
“可是到目前为止从来都没有人见过那个地方，所以甚至被认为是幻影呢。”乔伊继续解释说。
“想要知道不思议花园在哪里，可以跟着妙蛙花走就够了。”这时我回答道。
吃过晚饭后，没有休息，都在暗中观察妙蛙种子，想跟着妙蛙种子去不可思议花园，过了很长时间，我看到了妙蛙花出了门然后朝着花粉流动的方向去了。
“小圣，我们安静的跟着妙蛙种子走”，小智立刻去喊醒小圣。
“嗯，我们出发吧”小圣同意到。
“这是什么”跟着跑了一段时间后，就看到四周突然出现了许多的藤蔓，小圣看到后惊讶的说。
“你看，藤蔓要把前面的路堵塞起来了”，小圣看着前方这时也立刻说道，毕竟前面就是不思议花园了。
“这里有个洞，皮卡丘，你和卡咪龟先去，看着妙蛙花，我们等一下就来。
”我担心妙蛙花的安全，毕竟火箭队也会过来捣乱，所以先放卡咪龟和皮卡丘进去确认安全。他们慢慢在藤蔓完全堵塞前跳了过去，不过小圣这种女生运动能力没那么好，要看着点。
“皮卡丘~”（我们走吧。）皮卡丘带着杰尼龟进去了。
“卡咪~”“皮卡~”（好漂亮啊~），它们看到下面平坦的草地上有好多的妙蛙种子，然后妙蛙种子开始唱歌，那个干枯的树开始成长，并且开出了大片的红花，而且地上也开了好多的小花。
这时，它们后面出现了一只妙蛙花，卡咪龟被下了一跳，马上进去战斗状态。
“皮卡~皮卡丘~”（住手，卡咪龟）皮卡丘制止了卡咪龟的行为，行为它感觉这只妙蛙花很强，不是单单它们两个能对付的。
“皮卡~皮卡~”（不好意思，我们是好奇才过来的，请原谅我们失礼的行为。）皮卡丘带着卡咪龟向妙蛙花道歉。
“哒奈~”（没关系，你们过来一下，我有话对你们说。）妙蛙花没有怪罪它们，慢慢的往树洞中走去。
皮卡丘和卡咪龟跟了过去，它们在里面看到了我的妙蛙花。三个马上走到一起打招呼。
“哒奈~”（你为什么不进化，你有很好的资质，进化后能变得更强。）妙蛙花开口了。
“皮卡~”（我觉得我很喜欢这种形态，小智也不强求我们进化，他说变强不一定要进化，现在我不进化，也很少有雷丘能打赢我。）皮卡丘说出来自己的内心的想法。
“哒奈~”（不进化确实也能变强，进化是能更快的得到力量，你们还小，不懂。当年我也是这样认为，但直到失去最重要的东西的时候，我才明白，有些事情是不会等你慢慢变强的。）
“皮卡~？？？？”皮卡丘头上冒出来一堆问号。“
等我到达的时候，庆典刚好开始了，在妙蛙花的叫喊和妙蛙种子的回应下，妙蛙种子开始吸收飘着的花粉，一个个都进化成了妙蛙草。
就在这时，一个喵喵形状的热气球出现了，“…………（火箭队经典台词），哈哈哈——，妙蛙草和妙蛙花，我们就收服了。”武藏一边说一边从热气球下伸出一个大管子，而后小次郎按了一个按钮后，管子就开始吸气，好多妙蛙草都被吸起来了。
“不好，快救妙蛙草。”我看到妙蛙草好多都被吸了起来，我马上放出暴鲤龙，“暴鲤龙，破坏那台机器。”
“我早就有准备，十万伏特电网。”一张带电的的网罩住了暴鲤龙，电流上暴鲤龙根本无法动弹。“我也来帮忙。”当小圣也想出手帮忙的时候，妙蛙花出手了。
“哒奈~”妙蛙花一声大叫，地上出现许多藤蔓，直接将热气球包了起来，然后用飞叶快刀，将袋子割破，被抓的妙蛙草全部掉了下来，掉下来的妙蛙草被藤蔓接住，最后使出阳光烈焰，将火箭队炸飞。
“好讨厌的感觉啊~”火箭队变成流星飞走了。
“小智，这只妙蛙花好强啊。”卡咪龟说到，刚刚他看到妙蛙花的攻击都是一气呵成。
“这些都不重要，我的妙蛙花，卡咪龟和皮卡丘呢？”我现在才不管妙蛙花多厉害，我现在还没找到妙蛙花它们三个。
“哒奈~”“皮卡~”“卡咪~”（我们在这里。）皮卡丘它们从妙蛙花背后走了出，小智的波导告诉他这只妙蛙花就是自己的那只。
原本以为事情结束了，不过妙蛙花却给了我一样意外的东西。
“这不是mega石吗？而且还是妙蛙花的，为什么你要给我这个。”我对妙蛙花会给他这东西感到很惊讶。
“哒奈~”（听说你听的懂我们的话。）
“没错。”这一定是妙蛙花告诉它的。
“哒奈~”（这是我以前无意之中得到的，它能让我们妙蛙一族变得更强，现在它放在我这里已经没用了，与其让它放着发霉，不如送给你，或许你的妙蛙种子有一天能用到它。）妙蛙花解释到。
“那我不客气了。”难么好的东西，我怎么能拒绝，或许自己哪天真的能用上。