“妈，今天我要出发去芳源地区了”小智对妈妈说道，他已经在家五六天了，是时候该出去旅行了。
“这个啊，其实我早就为你准备好了，本来以为你在挑战完城都联盟后在家停留两三天就会走，没想到会那么快，这样我就有很充裕的时间来给你做新衣服了。”小智的妈妈一边从屋子了拿出一件衣服一边说道，“来，这是新的衣服。”然后递给了小智。
“谢谢，妈妈。”小智高兴的接过了衣服小智的衣服是一件蓝色的戴帽子的短袖上衣，一条浅蓝色的裤子，当然还有一顶帽子了。
“皮卡丘，伊布，小智以后就拜托你了。”花子摸了摸伊布和皮卡丘的脑袋。
“皮卡~”“布伊~”（没问题！）
“大木博士在吗？”小智来到了大木博士研究所，进了研究所后，小智喊道。
“哦，是小智啊！”大木博士从屋子里出来后看到小智说道。
“小智早啊”，小建也出来对小智打招呼说，看来已经很熟了。
“博士，我打算去丰缘地区挑战了，现在来带几只神奇宝贝，马上就要出发了。”进了房间后小智对大木博士说道。
“哦，你要出发了啊，没想到是今天啊！”，大木博士听到小智要出发了，也说道。
“是啊，决定的很突然，不过已经待了好几天了，已经休息的差不多了，神奇宝贝的训练情况也都交代清楚了，相信它们在这里也会很好的训练的，所以打算现在出发。”小智随后说道。
“那你打算要带哪些神奇宝贝啊”，这时大木博士又继续问道。
“皮卡丘和伊布是必须带的，还有班吉拉母子，忍者蛙。”小智立刻回答说。
“好，小建，你去把小智的神奇宝贝球取过来吧”，大木博士听了小智的话后，对小建说道。
“嗯，知道了”，小建说完后就离开了，去找神奇宝贝球去了。
拿到球后小智开始搭上前往芳源的船，在船上的时候，小智站在船尾看着真新镇的方向，自己的旅行再次开始了。
另一边，芳源的女主也开始了她的旅行，先来个自我介绍:我叫小遥，今年10岁。现在正前往未白镇，我将从父亲的好友小田卷博士那儿领取到我作为新人训练家的第一只初学者神奇宝贝，这样的话，我就踏出神奇宝贝训练家的第一步咯~~~
怎么说呢~~事实上我也很想到世界各地看看，但……
就在这时，小遥的身旁忽然冒出一只长相非常吓人的神奇宝贝，惊慌失措的小遥顿时把握不住单车，一头撞上了一棵大树。
“但……我还是不怎么喜欢pokemon啦！”就在小遥这样苦笑着的时候，未白镇已经近在眼前咯！
“不过~~~还是旅行最棒了~~~”
‘各位旅客，三代镇到了’，在经过了两天的乘船旅行后，小智终于踏上了宝石大陆——丰缘地区。
“接下来，先去未白镇，找小田卷博士拜访一下吧”，小智想了想后下了决定向小田卷博士研究所前进了，结果小田卷博士不在研究所，到后面森林去了，小智决定去找他。
“出来”，在走到森林的一处地方的时候小智就听到一位女孩的声音，于是就顺着声音向那边走去。
“哦，是水跃鱼”，小智走到那里就看到一位穿着白大褂儿的人正挂在一棵树上，小智一眼就认出了是小田卷博士，而树下是三只土狼犬正在对着他吠叫着，旁边是一位穿着红衣服，紧身短裤，扎着红色头巾，棕色头发的女孩，她就是小遥。
“接下来怎么办？”这时小遥看着脚边的水跃鱼茫然地对小田卷博士问道。
“用绝招，使用水枪。”小田卷博士对小遥说道。
“绝招？哦，水枪”，听到博士的话，小遥就对水跃鱼说道，然后可爱的水跃鱼就发射了水枪，可是却不是朝着三只土狼犬，而是冲着女小遥去的，射了她一脸。
“哎~”小田卷博士很无语的说，这时什么队友啊！。
可能是小田卷博士太重了，这时挂着博士的树枝也断了，博士掉了下去，开始被三只土狼犬追赶。
“皮卡丘，十万伏特。”十万伏特打土狼犬面前，土狼犬被吓得惊慌失措的逃走了，也不知道皮卡丘的攻击怎么回事，居然会转弯，无缘无故将旁边的自行车变成的鱼骨头。（知修：“皮卡丘，你这个单车杀手…干的漂亮！”小智：“靠！我又要赔钱了！”）
“你是？”小田卷博士看着为他解围的小智问道。
“小田卷博士，你好，我是真新镇的小智，，来丰缘地区进行挑战，所以现在来拜访。”小智这时候还没意识到皮卡丘闯的祸，有礼貌的对着小田卷说道。
“哦，你就是小智啊，大木博士常提起你呢，你为我们这些研究人员提供很多的研究素材呢！”，小田卷博士一听是小智，立刻就说了起来，大木博士的最得意的训练家，他们早就听说了。
“啊！我的自行车啊！看来不能再骑了…”小遥看着面前的自行车残骸说到！
“那个…”小智也十分尴尬，他这时候才想起皮卡丘干的好事，连忙将皮卡丘按倒，然后鞠躬道歉，“十分抱歉，皮卡丘不小心把你的自行车弄坏了，我会陪你的。”“皮卡皮卡~”（对不起！）
“那个…算了，皮卡丘也不是故意的，我叫小遥。”女孩看到小智都道歉了，还提出赔偿，也不好意思再指责小智…就原谅小智。
“你好，我是小智，这是我的伙伴皮卡丘和伊布。”小智又重新介绍自己说。
“我们先回研究所吧！”在收回了水跃鱼后，小田卷博士最后决定先回去再说。
“小遥，要选择最初的神奇宝贝了吗？”在研究所里，大家稍微的休息了一下后，小田卷博士开始让小遥小遥选择初始神奇宝贝。
“这个神奇宝贝球里面装了初学者的神奇宝贝。”小田卷博士指着桌上的三个宝贝球说道，“首先是这个，木守宫”，率先出来的是草系的木守宫。
“啊，它瞪我耶”，可是小遥看着木守宫的眼睛怕的躲到了一边。
“不…它只是看你！”小智连忙解释到。
“这个叫做水跃鱼”，小田卷博士继续放出来的是水系的水跃鱼。
“可是水跃鱼刚才并不怎么听我的话。”小遥想到刚才的事说道，毕竟是初学者，小遥没有任何经验，无法让水跃鱼听从她的话。
“接下来的是火雉鸡”，最后的当然就是火系的火雉鸡了，“火雉鸡是火焰系的”。
“这一只好可爱啊，我想要，好，我决定要火雉鸡了”，火雉鸡一出来就去亲近的蹭小遥的裤脚，小遥也很喜欢火雉鸡，于是最后选择了火雉鸡当初始的神奇宝贝。
“这是神奇宝贝图鉴，跟神奇宝贝球，好好加油，一定可以成为超越你父亲的神奇宝贝训练家”，看到小遥选好了神奇宝贝，小田卷博士就把神奇宝贝球和图鉴交给了小遥。
“说实话其实我一点也不想成为训练家。”小遥嘀咕道。
“你说什么？”小田卷没有听清楚小遥说的话。
“没有！我会加油的！”小遥连忙掩饰，小智知道她因为她父亲的粗暴的神奇宝贝原因影响了她对训练家的误解，这个一时半会无法消除，小智决定慢慢来。
“接下来你们先去神奇宝贝中心吧！下一个城镇是古辰镇，路上小心。”因为时间还早，所以小田卷建议他们出发到另一个城镇。
“好的，再见了，小田卷博士！”小智挥手告别小田卷。
“唉~想到一个人走过去，有点怕怕的，要是有自行车就好了！”小遥故意自言自语的说到。
小智和皮卡丘脸一僵，感觉非常尴尬。小智知道小遥在想什么，所以决定伸出邀请之手，“要不我们结伴而行吧！一起旅行也有个照应！”
“好啊！”小遥马上答应，这样她就不用再害怕突然冒出什么奇怪的神奇宝贝来了。
就这样，两个人一起向着古辰镇前进。