当然，在史玉柱复出之后，段永基和史玉柱的关系绝不仅仅是提供宏观理念上的启发，从史玉柱踏入资本市场的第一天起，段永基就与史玉柱站在了一起。2001年，上海华馨投资有限公司收购青岛国货得以完成，“青岛国货”更名“青岛健特生物”之后。在新的股东会中，段永基出任独立董事。不仅如此？从2002年开始，由段永基任董事长的中关村证券股份有限公司就一直停留在青岛健特生物的前十大股东名单之中。
段永基选中史玉柱，首先当然是因为脑白金和黄金搭档的赚钱能力。段永基在为史玉柱成功复出举行的座谈会上就说过，他曾打算收购史玉柱的原料供应厂，并由此得知史玉柱的销售规模和利润。到了担任青岛健特生物独立董事以及透过中关村证券持有公司股份的时候，自然对脑白金的黄金搭档的赚钱能力有更深入的了解。而在收购合同中有利润保障的条款，段永基也不怕万一市场突变，自己的巨资打了水漂。更为重要的一点是，他和史玉柱已经有了十多年的交情，而且在关键的时刻帮助过史玉柱，他绝不怀疑史玉柱的人格。毕竟，他买来的脑白金和黄金搭档要想变成利润，还需要史玉柱和他的团队来具体操作；毕竟，赚钱的项目容易找，可以信赖的合作者难寻。
四通收购黄金搭档公司股权，是一场双赢的游戏。在段永基一方，固然因为购入脑白金和黄金搭档这两个产品的知识产权和销售网络，从而享有这两个产品截至目前还算丰厚的利润，让上市公司四通控股；在史玉柱一方，从这笔交易中获得的也不仅仅是现金。这笔交易给史玉柱带来的6亿港币现金，可以让他投资于新的商业机会。虽然脑白金和黄金搭档拥有相当高的销售额，但由于巨大的广告投入，实际利润就要比销售额低得多了。扣除复出后还债支出的大笔资金，在2003年之前，史玉柱手里不可能有太多现金。而且，从长期来看，即便脑白金和黄金搭档可以避免一般保健品所谓“三年必死”的生命周期，能够长销，但未来的利润率也会走低，不可能一直保待鼎盛时期的高利润，这从青岛健特生物近几年的财务数据就可以看出来。在利润率走低的同时，由于脑白金和黄金搭档主打礼品市场，广告频率会直接影响消费者购买意愿，因此广告费的脑白金和一直没有取得预想成绩的黄金搭档再自然不过。况且，收购完成后，在脑白金和黄金搭档的整个价值链中，生产加工的一块仍然在史玉柱透过上海华馨控股的上市公司青岛健特生物里；由于只出售了黄金搭档公司75％股权给四通，史玉柱仍然可以享有25％的收益，但广告费用的大头可以转移到上市公司来承担。为四通控股CEO，并且于8月12日正式上任。8月10日，史玉柱前往香港，出席为他而召开的新闻发布会。段永基在2002年，那是史玉柱刚刚还清负债的时候，曾对史玉柱说：“你又有资格犯错误了！”月、27个月，这些条款细节上的商定可以看作是双方对合作的诚意。
2004年5月16日，史玉柱以四通的一员参加四通集团成立20周年庆典。在谈到与巨人投资公司史玉柱的合作时，段永基说：“史保利和珠海国利，而“利系”的丰富资源和强大支持将给史玉柱的未来运作留下巨大的想象空间，史玉柱找到了一个新的融资平台。有了段永基这样“德艺双馨”的资深企业家做生意伙伴兼“精神教父”，史玉柱有了新的人生目标。而且，他不再孤独上阵了。
5.投资银行，从企业家到投资家的转变
李嘉诚曾说过，投资首先是要看退出机制通畅不通畅，其次才是看收益高不高——我觉得很对，所以我想寻找的是风险不大、变现能力强的行业。基于这种认识，我投资了银行。
——史玉柱
在珠海巨人时代，史玉柱是个从不想向银行贷款的人。当初的史玉柱认为，用自己的钱比较安心。等到巨人出现问题，资金链断掉的时候，他发现民营企业从银行贷款真是太难了。以前的教训改变了史玉柱的看法，他不仅要向银行贷款，还要做银行的股东。此时的史玉柱更具有一个投资家的色彩。
史玉柱把脑白金和黄金搭档卖给四通之后，数亿元的现金进账，史玉柱开始向保健品之外的行业投资，他第一个选中的，就是回报稳定的银行业。
2001年1月，北京华资银团公司持有的发行人股份中，200万股被重庆市渝中区人民法院冻结。2002年10月31日，重庆渝中区人民法院对这200万股股票进行拍卖，史玉柱竞拍成功。在此之前，2002年4月22日和7月31日，史玉柱两次受让北京华资银团拥有的华夏银行发行人股份共5800万股；9月4日，史玉柱接受华夏银行发起人首钢总公司持有的8000万股华夏银行股份。这样史玉柱就一共持有了华夏银行1.4亿股股份，以持股5.6％位居华夏银行第六大股东。
华夏银行不是史玉柱投资的唯一的银行，2003年9月9日和11月13日，民生银行原第九大股东北京万通实业股份有限公司分两次将持有的14393.56万股股份转让给史玉柱，由于原第八大股东也将部分股份转让给了另外一家公司，史玉柱成为了民生银行的第8大股东。
对于投资银行，媒体多揣测史玉柱意图染指金融业，但史玉柱本人则表示对银行的投资纯属财务投资性质：
虽然在银行股上大赚，但是史玉柱也并不是没有失去过更好的机会。“宁可错过100个项目，也不错投一个。”史玉柱说他的投资原则不是谨慎，而是相当谨慎。为此，史玉柱在公司内部建立了一个七人的决策委员会，投票决定投资项目。当年，吴征决定退出新浪时，希望找人接手，有人找到史玉柱，问他要不要。一美元一股的价格，但决策委员会认为风险太大而没有买。而现在，新浪的每股估价已经达到了33美元。史玉柱的保守甚至也遭到了段永基的批评。2006年，段永基主导下的四通集团在香港投资8000万港币申购建设银行获利一倍，而四通控股在内地账户上有几亿元的资金——史玉柱同时也担任四通控股CEO，史玉柱却由于没有好的项目而不愿意投。但是在史玉柱看来，只有这样的谨慎保守才不会翻船。但是他也多少有点羡慕段永基当年接下了吴征转让的新浪股份：“他才投了500万，回报率比我高”。史玉柱认为，对于银行的投资，基本上是一个可以坐享其成的项目，尽管也需要巧妙安排来获得更高的收益。
6.投资能源，绝不放过任何一个投资热点
我既不是一个成功的投资家，也不是一个成功的企业家。我觉得我过去可能还想往实业家的方向发展，现在实际上是一个投资者，说难听点儿就是一个资本家的身份。“巨人”已经是一个资本领域的品牌了，我更喜欢“资本家”这个职业。
——史玉柱
史玉柱在几家银行埋下财富的种子之后，随后，他把投资利剑指向了升值潜力最大的能源领域。在2004年，能源市场上似乎充斥着机会，其中最为惹眼的国内能源和原材料价格持续上升带来的投资热潮。这个热点史玉柱没有放过。
史玉柱还真有点势如破竹、乘胜追击的气势。2004年11月24日，史玉柱旗下健特生物宣布投资2.29亿元，收购唐山港陆钢铁股份有限公司所持有的港陆焦化75％的股份。公告称：“公司本次收购资产的目的是为了进入煤、焦一体化产业，为公司未来利润增长培育新的增长点，以期通过产业结构调整，分享行业增长带来的利润，不断提高盈利能力，回报公司广大股东。”根据史玉柱与唐山港陆钢铁公司签署的《关于资产转让合作备忘录》，它分享的将是高达每年2亿元的利润。因为唐山港陆钢铁作了保证：港陆焦化2005年～2007年，每个年度净利润不少于2亿元，如果盈利达不到保证目标，港陆钢铁须对盈利不足部分进行补偿。
港陆焦化成立于2003年7月，由港陆钢铁和香港朝俊公司共同出资，其中港陆钢铁占有75％的股份，注册资本2900万元，主要是由港陆钢铁原所属焦化厂资产注资形成。根据山东汇德会计师事务所提供的（2004）汇所审字第5-077《审计报告》显示，截止到2004年11月20日，港陆焦化总资产为2.88亿人民币，净资产达到2.36亿人民币。