曾国荃非常痛恨李秀成死守天京城，让他费了那么大的力气，伤透了脑筋，吃够了苦头，才能把天京攻下。这次李秀成被俘，曾国荃为解心头之气，狠狠处罚李秀成。他要用尖刀和针锥狠刺，然后用刀一小块、一小块地把李秀成的肉割下来，慢慢地把他折磨死。
当他命人把李秀成带上来时，拿起针锥，像疯狗一样冲向被五花大绑的李秀成，在他身上一阵猛刺，一时流血简直像喷泉一样直向外飞溅，洒了一地！曾国荃还不解恨，又喝令刽子手把李秀成的肉一片一片地细割下来，李秀成满身血肉模糊，成了一块红通通、血淋淋的肉团。但李秀成并没有被这酷刑吓倒，相反，他挺起胸膛，威风凛凛地大喝曾国荃：“曾国荃！交战双方，各将士都为各方之主而战，你生什么气？而且，胜败乃兵家常事，这次被你捉拿，也只是偶然的，你就高兴得发了疯，你不觉得这有损曾家的大义吗？”
过了三天，曾国荃差人做了一个木笼，把李秀成装在里面。1864年7月28日，曾国藩从安庆赶到天京，亲自审问李秀成。后来他经过深谋远虑，决定就在南京杀死李秀成，以免夜长梦多，但他却狡猾地叫李秀成写一个供述，以便杀了他以后向朝廷有个交代。
李秀成当时有两种打算，一种是当敌人用刀锥加害于自己时，就慷慨壮烈地牺牲；另一种是，当敌人放下刀俎时，就暗中跟随他们走一段路，伺机东山再起。“留得青山在，不怕没柴烧”，李秀成深谙其中真意。
所以，曾国藩叫他写供述，李秀成就认为这是他实行第二选择的好机会。他忍耐、迁就于曾国藩，从见曾国藩第二天就开始写自述，用委婉、曲折，甚至巴结曾国藩的语气进行他的秘密计划。在炎热的夏天，囚笼之中，为达到他的目的，李秀成争取时间拚命地挥写，以每天七千字的惊人速度，去赶写这一部自述。
李秀成在写自述的第五天，曾国藩就与心腹赵烈文经过多方面的考虑与商议，最后一致以李秀成“狡猾多端”为借口，下决心把他杀害。
在李秀成写自述的第八天，曾国藩又亲自和李秀成谈了一次话。李秀成在谈话中，借机劝曾国藩称帝反清。曾国藩当时确有称帝之心，但他的顾虑太多，并没有采纳李秀成的劝告。而在第二天下午，李秀成还在赶写自述时，就把他拉出来杀了。李秀成在赴刑场时，神色镇定自若，微笑着踏上刑场，并吟诗作词十句，表现出他视死如归的精神和英雄气概！
李秀成自幼就受到忠、孝的教育，是个孝子，极其孝顺他的母亲，每次有重大事情出去或出差在外，凡是有可能，必定先辞别他的母亲。
再者，他出生雇农，久经革命锻炼。他一生忠心耿耿，尽了他的“愚忠”之心。尤其是他没听取李世贤兵谏他不要入天京城，而去天京哭着谏天王不要守天京，弃城突围，天王不听。李秀成见天朝已无多大希望了，就当着满朝文武的面，叫天王给他赐死，以免日后落在清兵的手中。
当天京失陷时，他甚至连家中的老母都没去救，而先将幼天王解救突围，足见其忠大过孝。而且在关键时刻，将自己的战马让给幼天王，结果自己落了难。还有在荒山逃难时，当地百姓叫他剃头避难，他硬是不肯，严正表示：“即使不幸落在敌人手里，也不过是死罢了。”从这一切事实中可见，在他的思想上，是早已有献身革命事业的准备了。
早在他被俘虏受刑的当天晚上，曾国藩的心腹赵烈文，劝李秀成投降时，李秀成表示：“朋友之义，不能逾越，更何况受其爵位。”赵烈文又问他：“现在天京已经陷落，天下就要太平了，你以后有什么打算？”“死罢！”但他还有后文，“顾虑到长江沿岸都有原来的部将，能让我写信把他们遣散，以免彼此再战，生灵涂炭，就已死而无憾了。”从中可以看出，他为能保存革命力量，做任何牺牲都无所谓！
李秀成在表现出他的坚定不移的革命立场的同时，也有自己的打算。李秀成对当时的革命形势，有他自己的看法。他认为，太平天国的前途还很有希望，军事力量还很雄厚，广大人民还在拥护太平天国；而且清朝统治者内部，清朝与外国侵略者之间，都存在着尖锐的矛盾，他们的联合只是为了共同的目标，即镇压太平天国运动，但他们的各自利益却不相同；再者，现在幼天王已经脱险，太平天国几十万大军都在长江两岸，问题只在于一个有威望、有能力的领导者来统领，就可以复兴太平天国，而他自己正是合适的人选。另一方面，李秀成在他的思想意识里面，就已深深地受到《东周列国志》、《三国演义》中叙述的“勾践灭吴”、“姜维伪降”等历史故事的影响。现在国破被俘，自己又是太平天国的军师，军队的最高统帅，复兴太平天国已是责无旁贷了。所以，他决定在敌人用武力时，自己就慷慨就义；当敌人用文的时，只要有一线生机，即使忍辱负重，也要坚挺下去。
因此，在他写自述第八天熄灯之后，乘着曾国藩又过来和他谈话之机，劝曾国藩称帝，自己假降曾国藩，以苟且偷生，伺机重振太平天国革命运动。当时曾国藩掌握湘军，占有长江中下游广大地盘，湖南、湖北、江西、安徽等省，到处都是他的士兵和战船。而这些富庶的产粮省份的粮食和税银则源源不断地输入他的金库。这强大的军事、物质的实力，曾几度使清皇朝极怕曾国藩推翻他们的统治地位；并且，曾国藩的党羽、亲信也企图拥他做皇帝，借机捞到好处。当湘军攻下安庆时，曾国藩的心腹大将彭玉麟就试探曾国藩说：“东南半壁无主，老师岂有意乎？”（《清朝野史大观》第八卷。）曾国藩在他老家湘乡建书屋，工匠做的上梁文就颂祝道：“两江总督太细哩，要到南京做皇帝。”而曾国藩本人，则表示他自己不听李秀成的劝告的原因不是“不敢”，而是“不肯”。这也说明了李秀成的计划并不算幻想。但是，曾国藩向来是个老奸巨滑的反革命傀儡，考虑问题很多，又有太多的顾虑，他和心腹赵烈文通过对李秀成的谈话和观察他在过去的一切活动，两人一致认为李秀成狡猾多端，阴谋诡计最多，所以曾国藩非但没有中计，反而看穿了李秀成的如意算盘，决定趁早把李秀成解决了，以免发生意外（如果把李秀成押解北京，不免在途中遭到太平军的劫逃）。
就在8月7日下午，当李秀成还在忙着写自述时，曾国藩就派人通知他，当晚就要把他处死。李秀成仍在写自述，一听到这件事，就停笔震惊了好一阵子，知道自己全部的心思都白费了。镇静之后，他倒心平如镜地准备去死，因为他已竭尽全力了。到晚上赴刑场的时候，他仍“谈笑自若”，像没事儿一样。行刑前，他作词十句，词中叙述了他的忠诚之情，同时也有称赞和感恩曾国藩的语意，这很大可能是李秀成的另一目的，因为他在狱中，曾国藩来谈时，李秀成曾向他提出三个条件，其中就有不要追杀太平军余部，把他们遣散就够了。通过这最后歌颂曾国藩，就是防止他改变对自己的许诺，以保存太平军的实力，这充分体现了李秀成自始至终一直是对太平天国忠心耿耿的。