孙万鹏出了一套世界首创的书——“灰学”系列专著，共13本，320万字。1995年由山东人民出版社结集出版了《孙万鹏灰学文集》共3册。
全国著名学者、专家组成的评议委员会认为，孙万鹏“不啻于放了一颗文化原子弹”，是推动人类思维方式的一场革命。经CABI光盘、美国国会图书馆光盘数据库等检索表明，灰学为孙万鹏首创，学术成就绝对居国际领先水平。
孙万鹏的灰学由《灰色价值学》、《灰农学》、《表现学》、《调查学》、《改革学》、《选择学》等组成。其中《灰农学》已被中组部组织的农村工作研讨班作为辅导教材。
1996年10月14日，中宣部常务副部长刘云山、副部长徐光春接见了向首都大专院校赠送灰学论著的孙万鹏，对灰学理论与文集的成功创建并出版表示祝贺。刘云山在接见中说：“在我国，省长、部长多得很，但灰学创始人只有你一个。现在有理由相信，你的灰学理论将会逐渐显示出它的价值，从而流芳百世。”
这样一部填补人类文化史空白的巨著，是孙万鹏在同病魔搏斗的9年中写出来的。
9年书写320万字，任何健康的写作高手都会叹服，更何况他是在病中。
孙万鹏1940年生于瓯江畔鹿城一个裁缝家中。1959年考入浙江农业大学。43岁当上浙江省农业厅厅长。
在主持厅里日常工作中，他在图书馆做了大量的研究，想要探索一条开放型农业之路。
1982年，华中理工大学邓聚龙教授创立的“灰色系统理论”，在国际论坛引起轰动。当时孙万鹏正在中央党校学习。他敏锐地感觉到，邓教授以数学语言揭示的理论，其价值不低于刚获诺贝尔奖的普里戈金的“耗散结构”理论。如果以现实的人类生活为分析对象，深入开掘灰色理论的内涵，将会对人类做出一个大贡献。
一种责任感和使命感油然而生。孙万鹏利用工作之余博览群书，广泛收集资料，打算把这一套灰学的宏篇巨著撰写出来。
正当他满怀抱负之时，1987年9月，他患了癌症。简直是晴天霹雳。他首先想到的是，他还有多少时间写灰学。他要和时间赛跑。他下决心，一定要把这部巨著完成。
病魔的折磨，常使他失去知觉。醒来之后，他立即拿起笔写作，就像刚刚睡醒一样。写着写着，他觉得力气不够了，就做一下气功，接着再写。他只有一个念头，一定要把灰学写完。他写出一本，来不及停顿，赶紧写第二本。他要写出全部内容。
狄更斯说：“顽强的毅力能征服世界上任何一座高峰。”坚定的学术使命和热烈的写作感受，加上积极的治疗和亲友的关照，他竞奇迹般的活下来了。9年，他终于完成了灰学巨著。心愿满足了，但是他没有停顿。他又开始写大众灰学丛书：超越爱因斯坦广义相对论与量子论的《全准思维方式》和《全准论》。