光帝气愤地询问侍卫曰:“基地戒备森严，敌人是如何渗透进去的？”
“不是敌人所炸，是战舰自己爆炸的。经过勘察发现是投降过来的战舰中安放有中子弹。”侍卫回道。
光帝恍然大悟叹气“唉…”曰:“原来如此，我总感觉龙飞没那么容易放弃，只是没想到他会这样。真是气煞我也。”
麦克尔站在一旁不语，侍卫退下。光帝闭目沉思，过了片刻，光帝睁眼对麦克尔曰:“此事是你的疏忽，你要想办法弥补，不然的话你就以死谢罪吧！”
麦克尔吓得吞吞吐吐地应曰:“我…我一定会给您一个满意的交代，如若处理不好，我…一定会…会……”
光帝打断他的话曰:“好了，我只给你半个月的时间，一定抓住主谋，否则……就不用我说明了吧？”
“是，我一定尽力而为之，不会让陛下失望的。”麦克尔自责地道。说完麦克尔转身离去，来到南海海军基地勘察现场。此时海军基地已经被炸的面目全非，难以修复。看着眼前的一切，损失惨重，麦克尔真的是欲哭无泪，懊悔不已。只恨自己为了早日成名建功，被利益蒙蔽住了双眼，太过于疏忽了。
在非洲刚果的龙飞接到帝军的南海第一海军基地被炸毁的信息，心中不仅是得意，更是欣喜若狂。由于黑暗计划第二步的成功，龙飞开始着手第三步计划的实施，也就是黑暗计划的最后一步。
正当所有人都沉浸在海军被炸的事件之中，另一个计划正在悄无声息地酝酿着。光帝所有的心思皆放在海军的重建上，这又给龙飞等人有机可乘。
一大批身怀绝技，身手敏捷，功夫非凡的人，秘密潜入皇都之城，来拯救清儿，为首之人不是别人而是龙飞。他对皇宫的一切了如指掌，非常熟悉皇宫中的各种路线。
然中央情报局也不是吃素的，一大批不明身份的人潜入皇都，中央情报局自然也有所察觉。经过查明之后就把报告递于光帝，光帝也做了各种防备，光帝心想:次日而来莫非是为了营救清儿。
光帝在闲余时间，来到了软禁清儿的地方。清儿不屑地瞥了光帝一眼，曰:“你来这干什么？你最好不要打什么有辱你人格的主意。”
“我来看你呀！好些日子没见了，心中啊！有些思念了。”光帝挑逗曰。“你觉得我能打你什么主意呀！”
清儿气愤不已，謇口曰:“你…无耻。”
“是么，我没觉得呀！”光帝继续地挑逗道。
清儿实在是不耐烦了，曰:“你要有事就说，没事就请你离开，我还要休息呢。”
“没有什么事，只是告诉你一下，给你换间房。”光帝回道。
清儿疑惑地问:“为什么？你要把我弄哪里去，是要杀我了么？”
“你多想了，我不会杀你的，你那么漂亮，我也不舍得呀！只是觉得这里不安全了，想给你换一个地方。”光帝答道。话音刚落，帝就命人把她带走了。安置到了另一个密室——很难找到。
次日夜深人静，秋风飒飒。一群身穿黑衣，全副武装的人，来至皇宫门外，利用空间转移器，移至皇宫之中的万卷楼——万卷楼乃是皇家的图书馆。
万卷楼离宣德殿很近，龙飞使用无线地底声波，监视着光帝的一举一动，一言一行。试图找到关押清儿和明亲王的地方，黑暗计划的最后一步就是营救明亲王，然后利用明亲王的势力，让世界再次发生大战，等地球打的不亦乐乎时，黑暗星球在来个鱼翁得利，趁势攻占地球。
等到光帝回到乾德宫休息之后，宣德殿内空无一人。龙飞就带人秘密潜入宣德殿中，偷阅光帝的笔记和他的电脑。企图找到有关关押清儿和明亲王的蛛丝马迹，但都无果。
找不到有关信息，于是他们又来到乾德宫前。在僻静的地方使用无线地底声波，来探听光帝的谈话，希望能从光帝口中了解到关押地点。
光帝正在考虑如何处置清儿。他心中对她还是有点爱慕之意，所以一直不忍杀她。爱米似乎看出了光帝的心思，有点嫉妒地向光帝说清儿的谗言曰:“你打算如何处置她，如果您一心偏袒的话，恐天下人不服呀！”
光帝看看她，曰:“我自有分寸，这你就不要操心了。”
“那你现在把她关哪了？”爱米问道。
光帝应曰:“和明亲王都关在地下室。”
在外一直监听的龙飞等人，顿时喜讶万分。于是连忙行动，龙飞曾是文帝和光帝两代帝王的心腹大臣，对皇宫里的一切了如指掌，所以也知道皇家地下室在哪。龙飞带领数人来到地下室的入口，入口有四个士兵在把守。
龙飞等人使用无声激光枪，在那些士兵都不备的情况下，悄无声息地全部被消灭。龙飞的四个士兵，换上了那些被杀四个士兵的衣服，在入口放风。其他成员入内，进入之后一部分开始寻找清儿，而另一个部分人却在寻找明亲王，因为黑暗计划的最后一步，明亲王才是核心。
找到之后，明亲王问曰:“你们是何人？”龙飞拿下面具。“是你，龙飞，你要干什么？”
“当然是来救你了。”龙飞语气僵硬而严肃地回道。
明亲王迷糊不清地曰:“你们到底是何人？想要干嘛？不说清楚我是不会和你们走的。”
“哼哼…现在走不走不是你说的算，不走也得走。”龙飞冷笑曰道。说完他一掌打在明亲王的脑后，明亲王顿时昏厥。
另一队人也找到了清儿，并带她离开。两队人在万卷楼下相聚，准备一起突围皇宫。
皇宫的地下室入口有兵守卫，半小时换一队人。当下一队去接班上一队时，发现这一小队已全部遇害，而地下室中的清儿和明亲王都消失不见了，惊慌失措的这队人员连忙上报皇宫保卫科和警卫科，实施了全面的追捕。
此事惊动了熟睡的光帝，光帝听到士兵的禀报后，怒火中烧又疑惑不解地曰:“怎么可能呀！他们怎么会找到关押的地点呢？”又命令士兵曰:“展开全面搜索，不放过任何细节，不惜一切代价，一定要抓住他们。”
龙飞一行人，在万卷楼旁边利用空间转移器逃走了，还带着昏睡的明亲王。
侍卫经过一番的搜查，没有查到任何蛛丝马迹的线索。光帝怒不可遏地大声命令曰:“展开全球A级搜捕，一定要抓住他们。”
次日，他们回到非洲刚果的秘密基地。回到基地不久，昏睡的明亲王缓慢地睁开双眼，昏昏沉沉的头，模糊不清地看着眼前的一切，显得是那么地陌生，带着疑惑地心情强行地站了起来，心里想“这是哪里？”
片刻间，龙飞和清儿来到明亲王的面前，龙飞微笑曰:“你醒了。”
“怎么会是你，龙飞，这是哪里？带我来这干什么？”明亲王诧异地问道。
龙飞微笑着回曰:“这是我的基地，带你来这里的主要目的，是为了帮你重新夺回皇位。”
“帮我夺回皇位？”明亲王很疑惑不解，又问:“你们为什么要帮我，你们的目的是什么？你又是什么人？”
龙飞沉默片刻，回曰:“我是黑暗星球的人，帮你夺回皇位，当然我也是有目的的。我的目的很简单，就是帮你夺回皇位之后，割让一块土地，允许我黑暗星球在地球上建一个基地。”
明亲王沉思片刻，心里想：跟他们翻脸反而对我不利，这样其实也不错，不如我先听他的，借助他们的力量，以后真的夺回皇位之后，在一并把他们铲除。
明亲王想来一个“借鸡生蛋”，之后在来个“卸磨杀驴”。他的想法很好，但龙飞等人也不是傻子，他们也是借助明亲王的力量来统治地球，想扶植一个傀儡的皇帝，龙飞和明亲王都在打着各自的如意算盘，将来谁能胜利，还是未知。
明亲王对龙飞曰:“没想到竟然是卧地。怎么个合作法，你们又需要我做什么？说来听听。”
“我要让你重返政界与光帝夺权。重新做上神皇大帝的宝座。”龙飞带着严肃而有冰冷的表情曰道。
“那你以前为什么帮他，现在又为什么帮我？”明亲王突然反问道。
“因为那时我未暴露，知道你斗不过他，我只有听命于他。”龙飞直言道。
“算了我不追究了。”明亲王慨愤地曰，“我也正有此想法，我也在和光帝较量一翻，哪怕他是我的……”话说半截而止。
“是你的什么？”龙飞好奇地问道。
明亲王慌忙解释曰:“没什么…没什么…”但他心里想，我不能告诉他，光帝就是曾经的天地之王，我的祖宗。我说了如果被他泄漏了，天下人岂不骂我大逆不道。
龙飞似乎看出了什么，但他又不能问的太多，于是只有作罢。他对明亲王，曰:“你先休息，明日我就帮你联络各国首脑，你也联络你在军中的亲信，让他们拉拢人心，这样我们才有筹码和光帝对抗。”
“嗯，好，就这样，明日我就开始联络他们。”明亲王曰道。
由于明亲王被劫，光帝惶恐不安，忧心忡忡。虽然展开了全球A级搜捕，但仍杳无音讯。因为明亲王所隐藏的力量，到底有多大，光帝一无所知。光帝曾经在军中展开了大清扫行动，也惩处了一些军官，当然在大清扫行动中也冤枉了一些人，最后搞得人人自危，人心惶惶。于是为了军队和国家的安定，就停止了清扫行动。但明亲王的心腹军官仍然存在于军中，未曾清扫干净。
光帝以为关押住明亲王，那些军官就不敢轻举妄动，时间一长人心自然也就安定了。可是没想到的是，有人把他救走了。以前顾及明亲王是自己的后人，留他一条命，现在光帝后悔莫及。他知道大错已经铸成，又将会是一场新的战争。