由于夜神月回到自己家已经很晚了，所以他直接躺下就睡了。丝毫没有注意到在他睡着后的10钟，一群白衣人进入了他家里开始搜寻线索。
宫野志保也在这群人里面，她先是发现了衣橱里小孩的衣服不见了，然后又来到了夜神月的卧室里。看着熟睡的夜神月，宫野志保不由轻轻一笑，因为宫野志保知道自己研究的可以保持青春的ATPX4869已经成功了。（在剧场版鲁邦三世VS名侦探柯南）她趴在床边写下了一张纸条，塞在夜神月的枕头下，只漏出一个角。
随后，又轻轻吻了一下夜神月的额头就和那群白衣人走了。第二天一早，夜神月醒来，因为是星期六，所以不用去上学。夜神月就悠闲的刷完牙，穿上衣服。随后才发现自己枕头底下有一张纸。（代码：你的观察力是有多差啊。）
夜神月拿起那张纸，上面写着：土曜日，下午2点，POARO咖啡店见。本来夜神月还抱着是谁写的，到底去不去的的想法。不过当他看到右下角的名字为宫野志保时，他知道，他不得不去了。
于是，夜神月换了一套比较宽松的休闲装就出发了。来到POARO咖啡店时，就看见宫野志保喝着咖啡。宫野志保也看见了夜神月，就招着手让夜神月进来。
于是夜神月在进门的一瞬间，在店员不注意是施展伸骨功，（既然有缩骨功，那么久一定有伸骨功。）成功的变回了风雨辰，原本宽松的衣服也变得合身了，只是第一次会有点疼。（不要误会了，不是那个第一次。）
而宫野志保看到风雨辰过来后，低头一看，本以为会看到缩小版的风雨辰，结果看到的之有一双腿。宫野志保抬起头，发现风雨辰正用一双死鱼眼盯着自己。
宫野志保惊到脸咖啡都差点弄洒了。“你怎么。。。”宫野志保惊讶道。
风雨辰笑着道：“要的就是这种效果，你没有听说过吗？华夏有种功法叫做伸骨功。”他边说边坐在了宫野志保的旁边。
“那么，叫我来有什么事？”风雨辰点了杯咖啡后向宫野志保说道。
宫野志保紧跟着说道：“我和我姐姐要住进你家。”
“噗，什么？住我家？”风雨辰惊讶的把咖啡都吐了出来。
“嗯，没错。有什么问题吗？”宫野志保说着还一脸杀机的看着风雨辰，好像风雨辰不答应，她就会把风雨辰大卸八块。
“没问题，只不过你们为什么要住进来。”风雨辰对此很是疑问。
“因为我们要逃离组织，而我唯一的朋友就是你咯。”宫野志保耸耸肩说道。
“哦，这样啊。那你随便住，钥匙的话就在门口的信箱里。没什么事的话我就先走了。”说完，风雨辰就向着门外走去，而风雨辰走出店门的一瞬间，他再次恢复到了夜神月的模样。
然后，星期天时因为毛利大叔要去参加婚礼。所以也带上的柯南和夜神月，以及那不请自来的侦探三人组。
“真是的，我为什么再带上这几个小鬼啊。”直到新干线从车站出发，毛利大叔都一直在抱怨。
而一旁的小兰则是安慰道：“没办法嘛，毕竟他们的父母也答应自费了嘛。”
看着在座位上玩耍的侦探三人组，夜神月则是无奈的笑了笑。这时柯南看到了两个黑衣人，于是柯南拉了拉正在看杂志的夜神月的衣角，等夜神月转过头时，就指向那两个黑衣人。
夜神月看了那两个黑衣人后，轻笑一后说：“放心吧，不是Gin。不过你眼力真差，你没发现他们比Gin他们更瘦吗？真不知道你是怎么当上侦探的。”说完后又继续看杂志了。
柯南仔细的看了看后，摸了摸头说道：“抱歉，看来是我太紧张了。”
之后，柯南又去了一回厕所，结果好死不活的听到了黑衣人说要交易什么。于是柯南跑回来，拉着夜神月跑到了一旁说道：“我听到了，那两个黑衣人要交易什么。而且他们还提着一个箱子。而交易的金额居然是一亿元！”
夜神月听了后，说道：“那么那个箱子就是交易物品。”夜神月想了想后继续说道：“那你可以拿博士给你的窃听器啊，黏在他们的座位上。”
当柯南把窃听器黏吸烟室的座位上的时候，居然差点被他们发现。不得不说，现在的这个柯南，和原著里差太多了，莫非是自己帮他太多了？夜神月这样想道。
过了一会儿后，耳机里传来的声音。夜神月和柯南知道，他们开始讨论了。
“呼，终于可以抽烟了。”其中一个声音说道。
“是啊，当她看着窗外的美景的时候，嘭的一声，这条列车和她都将成为尘土。”另一个声音道。
“而我们就可以带着那一亿元去过上富豪的生活，哈哈哈！”
“嗯？这个是什么？”
“口香糖而已，可能是小孩子的恶作剧吧。”
随后就没有声音了，可能是他们已经离开了吧。柯南转过头问道：“雨辰，你怎么看。”
夜神月想了一会儿说道：“既然他们说终于可以抽烟了那就说明交易的对象不喜欢抽烟，而看着美丽的风景那就只可能是二楼。而二楼的禁烟区只有一个，那就是。。。。”
“餐厅！”柯南和夜神月同时说道。
一旁的侦探三人组则是很不解的说道：“什么餐厅。”夜神月微笑着回答道：“没有什么。我和柯南只是在讨论晚饭要吃什么而已。”
旁边的柯南附和道：“对啊对啊。”
然后，夜神月和柯南借用上厕所的理由来到了餐厅。柯南环视一圈后，并没有发现那两个黑衣人的踪影。
“看来他们已经完成了交易呢。”夜神月微笑着说道。
“嗯，在场拿着箱子的有三个人。那么炸弹一定在这三个人身上。”柯南推理着，旁边的夜神月则是微笑的看着柯南。随后，柯南叫来了毛利大叔盘查他们三个人的箱子，可是却没有发现炸弹，反而是柯南的头上多了一个红包。
“哎，你怎么每次都要花这么长时间呢。”夜神月无奈道。柯南看向了夜神月不解的说：“我的推理到底错在了哪里？”
夜神月微笑着说道：“新一，你一般得到珍贵的东西时，会怎么做？”
“我？我会好好保护，或者。。。。藏起来！”柯南恍然大悟道。
“没错，你刚刚下去找毛利叔叔时，我就在这里看着，没有一个人带着一个箱子出去的。这就说明。。”夜神月脱了个长音给柯南自己想。
柯南很是聪明，马上就说：“炸弹就在这个餐厅里！”
嗯，孺子可教也。“这次情况危急你就不用找了。”夜神月说完后，便走到了其中一张桌子下面，拿出一个箱子。他打开窗户，把炸弹扔向远方。一分钟后，嘭的一声，炸弹爆炸在了列车早已经过的地方。
那两个黑衣人呢，早就被夜神月打晕扔在的厕所里。新干线到站后，接到夜神月报警的警察也来到了新干线上，逮捕了他们。就这样，一起案件在开挂的夜神月的帮助下给解决了。