看到小茂他被传送了过来，小智他并没有和他争吵，而是问他：“你带上了足够强大的神奇宝贝来了吗？”
“放心吧，我带的是最强阵容。”
“很好，那么，把这里统统破坏掉！米娜！”小智说。
虽然小蜻它们不是小智的神奇宝贝，但这次，它们听从了小智的命令，对这里进行了大肆的破坏，当然，神奇宝贝的尸体也被取了出来，不然它们实在不敢如此破坏。
因为小蜻它们的大肆破坏，警报大响，从电梯里跑出来了非常多的火箭队杂兵，他们放出了一大群神奇宝贝，攻击小蜻它们。
不过小蜻它们实力可比那些杂兵手上的神奇宝贝强多了，很轻松地就把那些神奇宝贝给打败了，小修他们则迅速地把这些杂兵捆绑起来，防止他们逃跑。
“呵呵，小鬼，倒是有本事啊，敢打到我们火箭队的秘密指挥部。”一个小矮子从阴影中走出来，与他一同出来的还有一个高大的男子和一名女子。
“听好了，小鬼们！我们是三兽士！火箭队仅次于四将军的干部！我叫查克拉！”小矮子说。
“我叫欧卡。”高大男子说。
“我叫萨奇”女子说。
“行了，如果想自我介绍的话这样就够了！给我让开！三兽士！”小修说。
小修的神奇宝贝都进入备战状态，小智他们的神奇宝贝也是。
“呵呵，小鬼们看起来很生气呢。”萨奇说。
“不过如果我们说不呢？”查克拉问。
“那我们就打出一条通道！皮卡丘！十万伏特！”小智说。
“皮卡~丘！”（十万伏特！）
“毽子棉！保护！”欧卡放出了他的毽子棉使用“保护”，防住了皮卡丘的攻击。
“火恐龙！喷射火焰！”小茂放出了他的火恐龙作战。
“宝石海星！高压水泵！”萨奇放出了她的宝石海星出站。
“小胖丁！冰冻之风！”
“盔甲鸟！钢铁之翼！”查克拉也放出了他的神奇宝贝。
就这样，双方就此打了起来。
“这样不行！对方的经验跟我们比高太多了！我们一起上还只能牵制住他们！小修！你信得过我们吗？”小茂问。
“你说呢？”
“那就这样！你一个人下去下一层！我们在这里对付他们！但小蜻和你的其他神奇宝贝得借我们用！”
“没问题！小蜻！你们大家记得听他们的指挥！记住了吗？”小修毫不犹豫地答应。
小蜻它们点头示意。
“去吧！小修！”小蓝用超能之力给小修开辟了条通道，让小修过去，小修跑进电梯后，电梯门随即关上。
“可恶！”查克拉正打算追上去的时候，小蜻一招爆音波把他打飞，小智说；“你的对手！是我们！”
小修坐电梯到第四层后，看到了和第三层一样的场景，强忍着怒火，把神奇宝贝的尸体一个个拿出来。到了第五层后，发现这里除了更多的神奇宝贝的尸体以外，还有一群研究人员，一些研究人员一看到小修就在一旁害怕地发抖，不是害怕神奇宝贝的尸体，而是害怕小修，此时的小修就像是一座火山，随时都要爆发，他们的直觉告诉他们：只要他一发怒，他们就死定了！
虽然这听上去很可笑，但他们的直觉告诉他们，这绝对是真的！
小修阴着脸问他们：“这第六层不会也是这些神奇宝贝的尸体吧？如果是的话，我不介意当杀人凶手。”
“啊——”*N部分研究员被吓晕了过去，只有一个研究员还意识清醒，但已经被吓尿了。
小修大步走向那名研究院的面前，他还没问什么，那名研究员就什么都招了，他说第六层是关押那些试验成功，但已经失去理智的神奇宝贝的地方。
一听到那里关押的神奇宝贝是这种的神奇宝贝，小修一怒之下释放出了御龙之力，竟然把他吓死了。
不过小修不在意这事情，他找到了前往第六层的电梯，到达第六层，发现这些神奇宝贝都被关在那个能量牢笼里，数目不多，也就六只，但每个看上去都很凶残。
小修看到这些神奇宝贝，眼泪流了下来，他很清楚，这些神奇宝贝已经没有所谓的理智了，只是一群只知道破坏的野兽，他现在，除了杀了它们，没有别的选择。他把那些神奇宝贝放出来后，那些神奇宝贝全部扑向小修，然后，小修就把它们，“杀”了。
小智他们与三兽士进行一场大混战（场面太过混乱，不好写，我只好省略不写。），最终还是敌不过三兽士对自己的神奇宝贝残忍，败了下来，就在他们打算带走他们的神奇宝贝的时候，君莎小姐和国际刑警突然出现，三兽士不得不抛弃杂兵，跑进逃生电梯逃生。
最终，火箭队杂兵在君沙小姐和国际刑警的全力攻击下，被尽数逮捕，等联盟的工作人员来到这，看到这些神奇宝贝的尸体，都大吐特吐了一场，他们不得不把这些神奇宝贝的尸体小心翼翼地包裹起来，避免神奇宝贝的尸体再一次受到损伤，大木博士和正辉也赶到了这里，看到这些神奇宝贝的尸体，大木博士的手握紧到出血，正辉更是想把那些研究员痛扁一顿。
小修从电梯里出来，看到伤痕累累的神奇宝贝们和小智等人，赶紧上前治疗，小黄的话已经昏睡过去，据塞蕾娜说是为了给他们治疗，太过疲累而昏睡，于是小修优先治疗小黄，看到小黄清醒了过来，也就放心地治愈其他人，不过他果断滴把小智给忽略，毕竟小智的恢复力可是怪物级，不用治也行，他先给塞蕾娜和小蓝她们这些女生治疗，然后才开始治愈别人，小黄一清醒过来，就没有休息，而是给神奇宝贝们做治愈，所幸的是她体内的赐予之力帮她吸收大地龙脉的力量恢复自身，使她没有晕倒，可以一直治愈神奇宝贝。
等乔伊小姐带着担架前来这里，神奇宝贝们的伤势都已经不严重了，之前每个神奇宝贝的伤势都很严重，尤其是皮卡丘和小蜻，它们当时可以说是濒临死亡，差一点就可以见阎王了，要不是小黄给它们治疗，只怕它们早死了。
等到他们出来的时候，联盟的一名工作人员走过来问要不要接受英雄徽章，她说拥有这徽章就可以不用受集齐八枚徽章就可以挑战联盟大赛，但小修他们全部都拒绝，连露脸也不要，那名工作人员只能放弃。
在休息处，小智握紧他手里的纸杯，说：“小修，我差点害死了小蜻，我很抱歉。”
“虽然我很想揍你，但一想到第六层的神奇宝贝，我又觉得现在的自己已经没有了揍你的资格。”小修说。
“为什么这么说呢？哥哥？”小黄问。
“在第六层，有六只已经没有理智的神奇宝贝，我把它们，‘杀’了。”
小蓝正准备喝水的动作停了下来，小茂拿在手里的纸杯也因为他一松而掉到地上。
小智激动地抓住小修的衣领，质问他：“你说什么！？你把那些神奇宝贝杀了！？开什么玩笑！这不可能是你干的出来的事！你为什么要这么做！？”
“我若是不这儿做的话，它们会把人类和神奇宝贝给杀掉，然后被人杀掉。”
“这就是理由！？开什么玩笑！？我绝对不能接受！”小茂也抓住小修的衣领说。
在场的人都没有阻止，他们都觉得自己是第一次认识小修。
“所以，我想问你们一下，你们······”小修从口袋里拿出六个精灵球说：“谁愿意接收这些新生的神奇宝贝呢？”
“啊嘞！？”*7
“我是把那些神奇宝贝‘杀’了，但我只是把它们的意识杀了，它们自身又重新诞生出了新的意识，现在的它们就像是刚出生的孩子，纯洁无暇，我没有资格拥有它们，你们大家自己接受吧。”小修把那些精灵球放在地上，然后把它们打开，从里面出来了六只不同的神奇宝贝。
它们均非关都或城都的神奇宝贝，它们分别是：波士可多拉、勾魂眼、大嘴娃、七夕青鸟、长耳兔、暴雪王。
“大家自己······诶？！”小修话还没说完，就被波士可多拉抱在怀里，那只波士可多拉说很喜欢小修。
小修见状，不得不接受这个孩子。而小智则被大嘴娃喜欢上、小茂这边是七夕青鸟、小黄的是暴雪王、塞蕾娜的是长耳兔、小蓝最后被勾魂眼喜欢上。
“现在大家都有什么目标？”小修突然问道。
大家的眼神都变得凌厉起来，小霞和小刚说：“尽快成为天王！然后打击火箭队！”
“成为精灵掌门人！”小茂&小智。
“成为国际刑警！打击全世界的邪恶组织！”小黄。
“成为冠军！”塞蕾娜&小蓝。
“正巧，我也是想成为精灵掌门人，你们以后别被我撇下太多哦。我决定了！在我成为精灵掌门人后！我要重点打击火箭队！让火箭队接受他们应有的制裁！”小修说。
此时的火箭队并不知道，因为这个基地被他们发现，竟然导致他们在未来的某一天被灭掉，而灭掉他们组织的人，正是他们。