在前往枯叶市的途中，大家遇到了非常多的事：与连胜了98场的小明战斗，中途火箭队前来做坏事，被打飞；一行人在穿过一个不知名的森林里遇到有人被欺负，小智替他解围，小修了解事情原委后便跑到神奇宝贝学校去砸场子，他那些精辟的战斗理论就连校长都感到佩服，可当校长想挽留小修时，火箭队又跑出来捣乱，又一次被打飞；来到神奇宝贝疗养场，火箭队要抢神奇宝贝，被小智和小修再次打飞，之后小翠让他们带走一些神奇宝贝，小智按原著剧情带走了妙蛙种子、小修带走了走路草，并给它取名花铃、小霞、小蓝和小刚则没有要任何神奇宝贝、小黄带走了一只绿毛虫，并取名小蝶、塞蕾娜则带走了一只海星星；之后他们遇上了原著中的小火龙，小修想让那只小火龙认清那个人的真面目，让小智强行把它收服，并且将它带在身边，之后小火龙亲眼见识到那个家伙的可恶，一怒之下，小火龙竟然学会了“喷射火焰”，不过也差点酿成火灾，之后火箭队又跑出来闹事，又一次被打飞；之后一行人有如原著般遇到了杰尼龟军团，后来它们被火箭队利用，小智把它们救了出来，把火箭队再次打飞，杰尼龟被小智打动，决定跟着他，不过小修并不打算让剩下的杰尼龟当消防员，他和塞蕾娜、小霞、小刚一起分别收服了剩下的杰尼龟，小修给自己的杰尼龟取名杰克；之后一行人来到了正辉的灯塔，小智收服了原著中那只发育不良的大钳蟹，还见到了那只巨大快龙，小黄通过常磐之力很清楚地了解到这只快龙命不久矣，并且它还有一个后代要抚养，于是她答应它一定会代替它好好照顾它的后代，于是巨大快龙带着小黄到它的巢穴里，可火箭队突然跑出来捣乱，攻击了巨大快龙和小黄，巨大快龙一怒之下把火箭队打飞，之后让小黄带走它的孩子，小黄一看，是一只闪光迷你龙，身体颜色是紫色，于是小黄给它取名小紫。
在经历了这些波折，一行人终于抵达枯叶市。
“终于！终于抵达枯叶市了——”*7
“啊——我发誓！等解决完小修你的赐予之力！我马上跟你们分道扬镳！”小蓝激动地说。
这也难怪，在小智的带领下，一行人走到了连导航也找不出来的路段，因此，大家不得不放弃导航，依靠小智的波导之力指路，可却证明了小修说的“小智哪怕有波导之力还是会指错路！”，所有人也因此绕了这么远的路才终于抵达枯叶市，要知道，从华蓝市出发，只要走上正确的路，到达枯叶市所用的时间也就两天，可他们却花了七天，可见让小智带路的错误有多大。
“确实！小智！我是再也不相信你的波导之力了！”塞蕾娜说。
“现在在我们看来让任何人指路都比让小智哥哥指路来得好。”小黄说。
“你们······”咕咕咕~~~
小智一下子就瘫倒在地上，说：“好饿~”
皮卡丘也跟着瘫倒在地上，说：“皮卡~”（我也是~）
“说起来我也饿。”小修说。咕咕咕~~~
（不是只有你饿。）小蜻从精灵球里跑出来说。咕咕咕~~~
咕咕咕~~~*5
“呵呵！看来大家都饿了！”塞蕾娜害羞滴说。
“我们去神奇宝贝中心吃饭吧！”小刚提议说。
“吃饭！”小智、皮卡丘和小蜻一听到“吃饭”这字眼，马上满血复活，小智用波导之力勘测下哪里有神奇宝贝中心。
“找到乔伊小姐的波导了！（给乔伊家族强化了下基因）饭！我来了！”小智此时就像打了兴奋剂似的，以每分钟一马赫的速度冲向神奇宝贝中心。（是真的以这速度冲向神奇宝贝中心！连皮卡丘和小蜻也一样，不过小蜻是用飞的。）
“好！好快！”*4小黄、小霞、小刚和塞蕾娜惊讶到下巴都快掉了。
“好久没看到小智跑这么快了。”与其反之，小修则是感叹地说。
“是呀！记得最后一次是小智帮娜娜美姐姐送特快宅急便的时候。”小蓝也跟着感叹道。
听到他们感叹的内容，众人心想：（喂喂喂！你们说的那个能让小智跑得这么快的那个娜娜美到底是何方神圣啊！？难道她使用美食来诱惑小智的吗？）
“不说这个了！我们也快点到那边吧！”小修说。
“哦哦哦！”*5
等众人抵达神奇宝贝中心时，众人已经不知道该用什么词来形容目前的情况：小智正在和皮卡丘、小蜻三只（小智：‘你们是没把我当人来看待了吗！？’）正在大口大口地把他们眼前的食物送到他们那无底洞，等到他们吃饱的时候，小智可是挺着圆滚滚的肚子，看上去就像个孕妇，小蜻和皮卡丘更夸张，小蜻现在看上去就像一个大大的气球，皮卡丘看上去都像个水老鼠玛丽露。
“呵呵！我特别想知道他们是得饿成什么样？才会把自己吃成这样！”小修说。
“哥哥！我待会再吃吧！我想先治疗那些受伤的神奇宝贝。”小黄忽然这么说道。
这也难怪小黄会这么说，整个神奇宝贝中心现在可是处于非常忙碌的状态，原因就是因为他们得救治那些被马志士打败的神奇宝贝，尽管那些神奇宝贝的等级普遍很低，但数量实在太多了，乔伊小姐和吉利蛋都有些忙不过来了。
小修摸了小黄的头，非常欣慰的说：“你有这份心我们很高兴，不过先填饱肚子！不然你没足够的力量治疗！”
“明白！”
“大家也都快去吃吧！”小修对其他人说。
“嗯！”*4
带大家吃饱喝足后，小黄跑去帮乔伊小姐治疗神奇宝贝，小修一行人则是跑到枯叶道馆挑战。
“有嘎达！（太好了！）终于可以挑战道馆了！”小智兴奋的说。
“只希望火箭队别再来捣乱了！”小修说。
听到这话，别说是小智，其他人也不禁打了个寒颤，他们可是亲眼见识到那三人组的恐怖！本身就像个打不死的小强也就算了！可问题是他们还会随着被打飞的次数的增加而增加实力！到后来！不用皮卡丘和小蜻，还打不飞他们！（打败他们倒是可以。）
“总而言之！要是他们敢跑来打扰我神圣的道馆战的话！我非把他们碎尸万段不可！”小智一脸凶恶地说。
“好了！别露出这么凶恶的表情！赶紧挑战道馆吧！这次我先！”小修迫不及待地说。
“诶——可！额！”小智眼角抽搐了起来。
小修看小智的神情不对，心里忽然有个不好的预感：“小智！求你别告诉我是他们！”小修说最后两个字是加重音。
“皮卡丘！对一点钟方向的那个货物使用电磁炮！”小智愤怒地说。
“小蜻！破坏死光！”
火箭队（笨蛋）流星三人组一听到他们下达的这些指令，马上逃跑，可在小智的波导之力面前逃跑，无疑是作死的行为，于是，他们又这样再次被炸飞天，而一行人又听到了那耳熟的话：“好讨厌的感觉——”*3
不过火箭队三人组被打飞的同时，从他们身上掉出了三张票。小霞捡了其中一张一看，竟然是圣安奴号的船票！
“圣安奴号的船票诶！我之前就想做坐这艘船了！可是船票太贵了，买不起。”小蓝说。
而小霞却说：“圣安奴号的船票？我就有啊！”说着小霞还从口袋中拿出圣安奴号的船票。
小蓝看到小霞从口袋中拿出这张船票，眼珠子都快瞪出来了，下巴也快掉到地上了，对天哀嚎道：“有钱人啊——”
“不过就算加上小霞你手上这张，我们还是差三个人，这样的话我们当中就一定有三个人不能上船乘坐了。”小修说。
确实，所有人都想坐上这艘豪华游轮，可只有四张票，他们是七个人，不够分。
“不好意思！你们说错了！我手上刚好有四张票！”小霞却出乎意料地说。
“纳尼！？”*5（小黄还在神奇宝贝中心给神奇宝贝治疗。）
“不信你们看！”小霞又从口袋里拿出了三张圣安奴号的船票。
这下子别说是小蓝，其他人也作出了和小蓝一样惊讶的表情，异口同声地说：“土豪啊——”
“这三张船票是姐姐们给我的！她们说她们还得镇守道馆，所以她们就把她们自己的票偷偷交给我，说让我到枯叶市再帮你们再买三张票。”小霞说。
小修不禁在心里感叹道：（这剧情改变的也太夸张了吧！？小霞变成了超级土豪！本来只有三个人坐圣安奴号，现在变成了七个人，我现在特别想知道，还有什么剧情会遭到改变？莫非圣安奴号不会沉！？那样也不错！）
“哥哥？你们站在门口干嘛？不进去挑战吗？”这时，从神奇宝贝中心赶来的小黄说。
“啊！是小黄啊！那些神奇宝贝没问题了吧？”塞蕾娜问。
“没问题了！神奇宝贝们的伤我和乔伊小姐都治好了！现在只需静养就行了。”
“这样啊！”
“我是真新镇的小智！前来挑战枯叶道馆！”此时，先行一步跑进去的小智对里头大喊道。