因为科拿说如果现任的精灵掌门人不出现就无法成为下一任的精灵掌门人，小智非常失落，导致塞蕾娜也没心思跟科拿小姐挑战，科拿更是果断拒绝和小修的战斗，直接离开，不过当然“科拿在冠军争夺战放水”这件事马上成为第二天的头条，让渡非常生气，抛弃目前所有职务，前去寻找科拿，为自己正名，当然这都是第二天的事，而且在小修看来，这一切与他们无关。
一行人来到小橘子岛邻近的柚子岛，前去挑战柚子道馆，正好看到一个小女孩和一只小海狮被卷入海涡，小修用超能力将人救下，而且救下来的这个人正好是柚子道馆馆主阿义的妹妹玛莉。为了感谢小修他们，阿义带他们进入他的道馆。柚子道馆很特别，道馆的外面像一座宝可梦中心，而且里面没有对战场地，但在一层却有宝可梦跳舞的场地和餐厅，而对战场地不在道馆内部，这里更像一间训练中心。阿义邀请他们来这里跳舞，亦表示感谢，中途还邀请塞蕾娜，希望她能留在这里，因为他们这座道馆除了他的妹妹玛莉以外没有女生，让小智差点就砍死了这个家伙，如果不是因为塞蕾娜拒绝的够快，恐怕真的会出人命。
跳完舞后，阿义带他们到柚子河，跟他们解释，他们必须通过测试才能挑战他，测试内容是在柚子河上用绝招将跳出来的目标全部击中，结果自然是轻松过关，不过小智那边有点恐怖，就好像发泄怒火似的，让人觉得很可怕，不敢靠近。
到了第二天，小智要求第一个挑战，阿义自然无法拒绝，结果他的宝可梦被小智轻松打败，让小修他们松了口气，他们刚才还担心小智会不会故意攻击阿义，或者制造意外，显然他不会这么做，不过也对，他是小智，小智是不会做出这种事的。
其他人自然也是轻松过关，不过小修赞扬说通过跳舞锻炼宝可梦的速度和闪避能力确实不错，不过小修也指出不是所有的宝可梦都适合这种方法，他说这种训练方法如果是种族值速度占比较大的宝可梦更适合，当然体型较小的宝可梦也很合适。阿义接受小修的建议，但他也说自己是不会放弃这种风格训练宝可梦的，但他也会进行改进。就这样，三人离开了柚子岛。
离开柚子岛，三人来到大椪岛。岛上没有人类，只有两只宝可梦，从波导的感应来看，是大比鸟和钻角犀兽，小修用波导一看，这两只宝可梦的体型非常大，比一般的大比鸟和钻角犀兽大两倍，不过在他们看来，收服它们没有意义，体型大不代表实力就强大，不过很快就被人给收服了，而且还刚好是熟人。
火箭队三人组隔了五章再次登场，可惜还是一样，只是刷个存在感，然后再次被打飞。
离开大椪岛，小智他们继续在海上漂泊。
“诶？之前没仔细看，我发现大椪岛离亚细亚岛很近呢。”塞蕾娜看着地图说。
一听到亚细亚岛，小修和小智身上就开始冒黑气，小修满脸#字地说：“亚细亚岛啊~说起来咱们应该去见见老朋友了，不，是，吗~”
“我非常赞同。”小智松弛了下手上的筋骨说。
“那个，我们还是去别的岛吧，我刚才看了一下，亚细亚岛附近有一座很不错的小岛，我们去那休息吧？”塞蕾娜建议说。塞蕾娜很清楚，为了某人的生命安全，绝不能让他们去亚细亚岛！
“就算要去，至少也要先拜，访，拜，访，一下老朋友，不是吗？小智？”小修露出残忍的笑容说。
“嗯~你说的一点也没错。”小智眼睛瞪大，满脸戾气地说。
“你们两个······嗯？”塞蕾娜正想劝他们两个放弃的去亚细亚岛的时候，突然看到了不可思议的一幕：“三圣鸟它们在做什么？”
“嗯？”小智和小修往亚细亚岛的方向一看，亚细亚岛的上空，三圣鸟飞在上空，不断地往地面攻击，小智用波导一看，三圣鸟并非胡乱攻击，而是在对付三只宝可梦。
那三只宝可梦的波导很奇怪，在小智看来那简直就像花屏的电视，小修用超能力看了一下，竟然只能看到非常模糊的画面，简直就像有什么东西在干扰！？
“什么情况！？什么也看不清！”小修说。
“我这边也是！”小智说。
“这到底是怎么回事！？在亚细亚岛的那三只神秘的宝可梦到底是什么！？”塞蕾娜说。
“赶紧去岛上！雷！加速！”“不对吧！？你不是会瞬间移动吗？”
······空气瞬间凝固了，小修没有说话，阴着脸使用瞬间移动将他们传送到芙芦拉的身边，看到芙芦拉全身都是伤，晕了过去，她身边还有很多受伤的人与宝可梦，三人的脸瞬间黑了，塞蕾娜使用超克之力给他们治疗，很快就把他们治好，芙芦拉第一个醒过来，一睁眼就看到小智和小修的那张黑到比鬼斯还可怕的脸，下意识的一拳打飞，等回过神来才发现她打飞的是他们两个，赶紧道歉说：“对不起对不起！你们怎么会在这？”
“没事。”小修捂着下巴说：“你的拳头对我们而言太轻了。”
“嗯，确实。”小智看起来一点事都没有，站起来说：“感觉自己好像被蚊子叮了一下。”
（我这边是哄她的，你是真的这种感觉吧！？被花子阿姨锤炼的超强抗打未免也太强了点吧！？或者应该说现在只有花子阿姨才能让你感到痛吗！？）小修在心里疯狂吐槽说。
“问一下，是不是那三只宝可梦攻击你们的？”塞蕾娜阴着脸问。
“嗯，怎么？莫非你们想······”
塞蕾娜他们派出自己的王牌，翠蝶mega进化，皮卡丘赤雷模式，小蜻帕路奇亚形态，塞蕾娜说：“打败它们！”
翠蝶最先冲上去，对付闪电鸟对付的对手。闪电鸟对付的宝可梦看起来是虫系宝可梦，拥有类人的身躯，它的身体十分纤细，大部分是乳白色的。而且速度非常快，总是能躲过急冻鸟的攻击，翠蝶mega进化后速度变得更快，比mega翠蝶Y还快，但竟然很难跟上那只宝可梦的速度！
那只宝可梦看到对手换了，爆发出比之前更快的速度，速度快到如闪电般，塞蕾娜的肉眼很难跟上，即使使用超克之力辅助观察，也只能勉强看到身形。
皮卡丘对付火焰鸟的对手。火焰鸟的对手是一个看起来像折纸人的宝可梦，全身都是锋利无比的，它随便挥舞一下，就砍断了周围的建筑和树木。皮卡丘使出铁尾与它交战，结果是被打退，而且皮卡丘的尾巴还被它砍伤了！
小青对付急冻鸟的对手。急冻鸟对付的是一个超大嘴巴的宝可梦，从嘴里还伸出两个看起来就像头的东西，在不断的吃掉周围的一切，就连小蜻使出的亚空裂斩竟然也被它吃掉，虽然它看起来是承受了不小的痛苦才努力吞掉的，但那也很恐怖了！
（喂喂！这是什么怪物啊！？连亚空裂斩也能吞掉！？虽然我的亚空裂斩目前不能跟真正的帕路奇亚施展出来的亚空裂斩相比，但也不容小视啊！）小蜻惊讶地说。
“皮卡皮卡！”（我这边也一样啊！）皮卡丘说：“皮卡皮卡丘！”（我的尾巴差点就被它砍掉了丘！）
（我这边也是！）翠蝶说：（它的速度太快了！我跟不上！）
“怎么会这样！？你们到底是谁！？”塞蕾娜问。
（肮脏，太肮脏了，这里的一切都太肮脏了，我都不屑去碰。）那只乳白色的宝可梦说。
（我不想砍东西，但我就是没办法，你们为什么就是一定要攻击我！）折纸人说。
（我好饿！刚才的那个东西，好好吃！虽然不好消化，但好好吃！）大嘴巴说。
“皮？皮卡皮卡皮？”（奇怪？我怎么听不懂它们在说什么皮？）
（我也是，它们在说什么啊！？）小蜻问。
“你们听不懂吗！？”小修惊讶地问。
翠蝶它们同时摇头，小智惊讶地说：“不会吧！？我们明明就听得懂，为什么你们就听不懂！？”
“莫非······”塞蕾娜推测：“它们不是这个世界的宝可梦？”
“这话什么意思？！”小智问。
“还没听明白吗？它们来自ND所说的究极空间。”小修说。
“究极空间！是ND派它们过来的！”
“不知道，但我觉得，这一切跟她或多或少有点关系，不管怎么说，它们对付的对手都不适合它们，大家！交换对手！”小修大喊道。
“皮卡丘对付虫子！翠蝶对付大嘴巴！小蜻对付纸人！”小智进一步下达指令说。
皮卡丘它们交换对手，发现果然好对付多了，虫子的速度虽然很快，但皮卡丘可以比它更快，这样那只虫子非常惊讶，不过小修进一步确定，对方的属性绝对有格斗系；翠蝶使出月亮之力，攻击大嘴巴，结果效果群拔，那只大嘴巴无法吞掉翠蝶的月亮之力，让小修确定，对方的属性是恶系和龙系；小蜻切换成帝牙卢卡形态，与那只宝可梦刀爪互攻，发现它的身体有纸张和钢铁的特性，于是小修确定，它的属性是草系和钢系。
“皮卡！？皮卡皮卡丘！”（好奇怪！它身上散发着一种奇怪的味道，让我很难对它产生攻击的想法丘！）皮卡丘说。
（这混蛋好锋利！我现在的身体是非常坚硬的，但还是被它划出好几道划痕！）小蜻说。
“速战速决！”小修大喊。
皮卡丘使出超级雷电拳攻击虫子，竟然一拳打败了它！？这让皮卡丘怀疑这家伙是不是水货？翠蝶那边也是，使出电光闪耀秒杀对方，小蜻使出大字爆一招秒杀，让小修忍不住吐槽说：“搞什么啊！？未免也太不禁打了吧！？这才一招！一招就倒！？你们是哪来的雅木茶！？”
“那个，雅木茶是谁？”小智问。
“咳咳，不用在意，总之先将它们收服吧，将它们放生感觉会出事，那个大嘴巴我收服了。”
“行，那纸人就由我收服吧。”
“我收服虫子。”
塞蕾娜他们拿出精灵球，准备收服它们，结果空中同时打开三个究极之洞，从究极之洞里跑出三只宝可梦，分别是赤面龙、乌贼王和花洁夫人，它们变成半人形态，拿出一个特殊的精灵球将它们收服，乌贼王人说：“非常抱歉，因为主人的一点小失误，让这三只究极异兽跑到这个世界，我们的主人让我们替她向你们道歉。”
“开什么玩笑！”三人分别和自己的王牌合体，冲上去，要将它们抓住，ND突然现身，将小修他们击退，说：“我都想你们道歉了，你们还这么紧追不舍，真是小家子气。”
“ND！我们和你势不两立！这次你别想逃！”小智说。
“如果你们想这个世界不被破坏的话，最好放弃和我作对的念头。”ND突然这么说。
“什么意思？”小修问。
“你们领教了究极异兽的强大，应该明白它们的实力有多强。”
“虽然这么说很抱歉，但它们不禁打。”塞蕾娜说。
“不禁打？那只是你们的宝可梦比它们强而已，究极异兽大多数防御和特防都比较弱，但相对的，它们的破坏力非常可怕的，你们也亲身体会到了，费洛美螂那闪电般的速度，恶食大王的暴食，纸御剑的锋利。”
“费洛美螂？恶食大王？纸御剑？这些是它们的名字？”小修问。
“没错，你们人类取的名字，甚至还有代号，费洛美螂的代号是U B -0 2：美丽，纸御剑是U B -0 4：劈斩，恶食大王是U B -0 5：大胃王。而且究极异兽可不知它们三种而已，还有很多种类呢，最重要的是，每一个种类的数量都很庞大，想想看看吧，如果我在世界各地打开究极之洞，释放大量的究极异兽，想想看是怎样的光景吧。”
小修他们只能想到末日，它们的破坏力实在是太惊人了，如果真的让它们来到这个世界，无论是人类，还是宝可梦，都无法挡住！除了冠军和神兽们。
“所以你们明白了吗？别再和我做对了，当然，我也没打算对这个世界怎么样，因为我说过，我对这个世界已经失去了兴趣，所以，不准踏入究极空间，否则，等着迎接末日吧。”说完ND带着她的宝可梦离开，只留下一脸不甘的三人，小智解除合体，拳头重重的敲击地面，不甘心地大喊：“岂可修——”